<em>De novo</em> Identification of Actively Translated Open Reading Frames with Ribosome Profiling Data

Yanan Zhu; Fajin Li; Xuerui Yang; Zhengtao Xiao

doi:10.3791/63366

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Biology

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डे नोवो राइबोसोम प्रोफाइलिंग डेटा के साथ सक्रिय रूप से अनुवादित ओपन रीडिंग फ्रेम्स की पहचान

<em>De novo</em> Identification of Actively Translated Open Reading Frames with Ribosome Profiling Data

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De novo Identification of Actively Translated Open Reading Frames with Ribosome Profiling Data

डे नोवो राइबोसोम प्रोफाइलिंग डेटा के साथ सक्रिय रूप से अनुवादित ओपन रीडिंग फ्रेम्स की पहचान

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08:23 min

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February 18, 2022

DOI:

10.3791/63366-v

DOI:

10.3791/63366-v

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08:23 min

February 18, 2022

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Yanan Zhu*¹, Fajin Li*^2,3, Xuerui Yang^2,3, Zhengtao Xiao¹

¹School of Basic Medical Sciences,Xi’an Jiaotong University Health Science Center ²MOE Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, School of Life Sciences,Tsinghua University ³Joint Graduate Program of Peking-Tsinghua-National Institute of Biological Science

Summary

राइबोसोम का अनुवाद पेप्टाइड्स में प्रति कोडोन तीन न्यूक्लियोटाइड्स को डिकोड करता है। एमआरएनए के साथ उनका आंदोलन, राइबोसोम प्रोफाइलिंग द्वारा कब्जा कर लिया गया है, विशेषता ट्रिपल आवधिकता को प्रदर्शित करने वाले पैरों के निशान पैदा करता है। यह प्रोटोकॉल वर्णन करता है कि राइबोसोम प्रोफाइलिंग डेटा से इस प्रमुख विशेषता को समझने के लिए राइबोकोड का उपयोग कैसे करें ताकि पूरे-ट्रांसक्रिप्टोम स्तर पर सक्रिय रूप से अनुवादित खुले रीडिंग फ्रेम की पहचान की जा सके।