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Chapters
- 00:04Introduction
- 01:01Environment Setup and RiboCode Installation
- 01:23Data Preparation
- 03:35Removing Ribosomal RNA Contamination
- 03:59Aligning the Clean Reads to the Genome
- 04:25Size Selection of Ribosome Protected Fragments, Identification of P-Sites, and De novo Annotate Translating Open Reading Frames
- 04:59Results: Identification of the Novel Open Reding Frames (ORFs) with the Application of RiboCode
- 07:20Conclusion
राइबोसोम का अनुवाद पेप्टाइड्स में प्रति कोडोन तीन न्यूक्लियोटाइड्स को डिकोड करता है। एमआरएनए के साथ उनका आंदोलन, राइबोसोम प्रोफाइलिंग द्वारा कब्जा कर लिया गया है, विशेषता ट्रिपल आवधिकता को प्रदर्शित करने वाले पैरों के निशान पैदा करता है। यह प्रोटोकॉल वर्णन करता है कि राइबोसोम प्रोफाइलिंग डेटा से इस प्रमुख विशेषता को समझने के लिए राइबोकोड का उपयोग कैसे करें ताकि पूरे-ट्रांसक्रिप्टोम स्तर पर सक्रिय रूप से अनुवादित खुले रीडिंग फ्रेम की पहचान की जा सके।
