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De novo Identificazione di frame di lettura aperti tradotti attivamente con dati di profilazione dei ribosomi
 
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De novo Identificazione di frame di lettura aperti tradotti attivamente con dati di profilazione dei ribosomi

Article DOI: 10.3791/63366-v 08:23 min February 18th, 2022
February 18th, 2022

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La traduzione dei ribosomi decodifica tre nucleotidi per codone in peptidi. Il loro movimento lungo l'mRNA, catturato dalla profilazione dei ribosomi, produce le impronte che mostrano la periodicità caratteristica della tripletta. Questo protocollo descrive come utilizzare RiboCode per decifrare questa caratteristica prominente dai dati di profilazione dei ribosomi per identificare i frame di lettura aperti tradotti attivamente a livello di trascrittoma intero.

Tags

Biologia Numero 180 Profilazione dei ribosomi cornice di lettura aperta traduzione di mRNA micropeptide uORF dORF
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