علم الوراثة السكانية يشير إلى دراسة الاختلاف في الأليل وتواتر الجينات في المجموعة السكانية. هذا الاختلاف هو الذي يجعل التطور ممكناًالتركيب الوراثي للمجموعة السكانية يتميز بوصف تجمع جينات المجموعة السكانية،وجميع الأليلات في كل موضع في المجموعة السكانية. إذا كان هناك أليلان أو أكثر في موضع واحد،فقد يكون الأفراد متماثلي الجينات،ولديهم اثنين من نفس الأليل أو متباينة الازدواج،ولديهم أليلين مختلفين في موضع واحد.على سبيل المثال،في وراثة السناجب،هناك نوعان من الأليلات،R”و”B”في الموضع الذي ينظم نمو الفراء. السناجب متجانسة الأليل R”لها فراء حمراء. وأولئك متماثلي الجينات B”لديهم فراء بُني باهت والأفراد متباينو الازدواج لديهم فراء حمراء بنية.إذا كان هناك مجتمع تعداده 100 سنجاب مكون من 40 سنجاب أحمر و30 بني و30 أحمر بني،فإن تواتر الأليل R”هو 0.55 أو 55٪والأليل B”هو 0.45 أو 45٪يمكن قياس التغير في هذه التواترات بمرور الوقت لتحديد ما إذا كانت المجموعة السكانية تتطور.