Journal
/
Biology
/
DamID-seq: מיפוי הגנום של אינטראקציות החלבון-DNA על ידי תפוקה גבוהה רצף של קטעי DNA-מפוגל אדנין
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

DamID-seq: מיפוי הגנום של אינטראקציות החלבון-DNA על ידי תפוקה גבוהה רצף של קטעי DNA-מפוגל אדנין

DOI:
10.3791/53620-v

•

09:14 min

•

January 27, 2016

•

, ,
1Department of Cell Biology,Yale University School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

אנו מתארים זאת assay על ידי צימוד זיהוי methyltransferase אדנין DNA (DamID) לרצף תפוקה גבוה (DamID-seq). שיטה משופרת זה מספקת רזולוציה גבוהה יותר וטווח דינמי רחב יותר, ומאפשרת ניתוח נתונים DamID-seq בשיתוף עם נתונים רצף אחרים תפוקה גבוהה כגון שבב seq, RNA-seq, וכו '

Tags

DamID-seqGenome-wide MappingProtein-DNA InteractionsHigh Throughput SequencingAdenine-methylated DNA FragmentsNuclear OrganizationTranscription RegulationMammalian CellsGenomic RegionsAmyloidTranscription FactorsHigh ResolutionDNA MicroarraysCross-analysisGene CloningDamID VectorLentiviral StocksLentiviral Expression SystemCotransfectionLentivirus Infection

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/53620?article_type=v

Electroeluting קטעי DNA
check_url/53620?article_type=v

כמותיים אוטומטי תפוקה גבוהה הגנום כולו RNAi המסכים ג elegans</em
check_url/53620?article_type=v

תפוקה גבוהה מיפוי פיזי של הכרומוזומים באמצעות אוטומטי<em> באתרו</em> הכלאה
check_url/53620?article_type=v

מחיקות Gene הגנום ב<em> סטרפטוקוקוס sanguinis</em> על ידי תפוקה הגבוהה PCR
check_url/53620?article_type=v

דור של תבנית הכרומטין immunoprecipitation איכות גבוהה עבור ה-DNA רצף תפוקה גבוהה (שבב ואילך)
check_url/53620?article_type=v

שילוב מניפולציה מולקולה בודדת והדמיה לחקר אינטראקציות החלבון-DNA
check_url/53620?article_type=v

קשירת יעילה ביותר של RNA קטן מולקולות לMicroRNA Quantitation על ידי רצף תפוקה גבוהה
check_url/53620?article_type=v

ממוקד DNA מתילציה ניתוח על ידי רצף של הדור הבא
check_url/53620?article_type=v

הקרנת תפוקה גבוהה עבור כימית מאפננים של גני Post-תעתיק מוסדר
check_url/53620?article_type=v

הכרומטין immunoprecipitation Assay עבור זיהוי של אינטראקציות החלבון-דנ"א ארבידופסיס<em> In vivo</em

Read Article