Journal
/
/
Damid-seq: Genoom-brede kaart brengen van eiwit-DNA-interacties door High Throughput Sequencing van adenine gemethyleerd DNA-fragmenten
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
DOI:

09:14 min

January 27, 2016

, ,

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

We beschrijven hierin een test door het koppelen van DNA adenine methyltransferase identificatie (damid) tot high throughput sequencing (damid-volgende). Deze verbeterde werkwijze een hogere resolutie en een groter dynamisch bereik en maakt analyse damid-seq data in combinatie met andere high throughput sequentiebepaling gegevens zoals ChIP-seq, RNA-seq, etc.

Related Videos

Read Article