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DamID-seq: Genome-wide Mappatura delle interazioni proteina-DNA da High Throughput Sequencing di Adenina-metilato frammenti di DNA
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Biology
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JoVE Journal Biology
DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
DOI:

09:14 min

January 27, 2016

, ,

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

Descriviamo qui un test con l'accoppiamento di identificazione del DNA adenina metiltransferasi (DamID) ad alto rendimento sequenziamento (DamID-ss). Questo metodo fornisce una migliore risoluzione più elevata e una gamma dinamica più ampia, e permette di analizzare i dati DamID-Seq in combinazione con altri dati di sequenziamento ad alto rendimento, come ChIP-seq, RNA-Seq, etc.

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