Journal
/
Biology
/
DamID-punkter: Genomvid Kartläggning av protein-DNA interaktioner från hög genomströmning sekvensering av Adenine-metylerade DNA-fragment
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

DamID-punkter: Genomvid Kartläggning av protein-DNA interaktioner från hög genomströmning sekvensering av Adenine-metylerade DNA-fragment

DOI:
10.3791/53620-v

•

09:14 min

•

January 27, 2016

•

, ,
1Department of Cell Biology,Yale University School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver häri en analys genom att koppla DNA adenin metyltransferas identifiering (DamID) till hög genomströmning sekvensering (DamID-punkter). Denna förbättrade metod ger en högre upplösning och ett bredare dynamiskt omfång, och låter analysera DamID-seq uppgifter i samband med andra high throughput sekvense data såsom Chip-punkter, RNA-punkter, etc.

Tags

DamID-seqGenome-wide MappingProtein-DNA InteractionsHigh Throughput SequencingAdenine-methylated DNA FragmentsNuclear OrganizationTranscription RegulationMammalian CellsGenomic RegionsAmyloidTranscription FactorsHigh ResolutionDNA MicroarraysCross-analysisGene CloningDamID VectorLentiviral StocksLentiviral Expression SystemCotransfectionLentivirus Infection

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/53620?article_type=v

Electroeluting DNA-fragment
check_url/53620?article_type=v

Kvantitativa och automatisk hög genomströmning Genomvid RNAi skärmar i C. elegans</em
check_url/53620?article_type=v

Hög kapacitet fysisk Kartläggning av kromosomer med hjälp av automatiserad<em> In situ</em> Hybridisering
check_url/53620?article_type=v

Genome-wide Gene Deletioner i<em> Streptococcus sanguinis</em> Av High Throughput PCR
check_url/53620?article_type=v

Av hög kvalitet om Kromatin Immunoprecipitation DNA Mall för hög genomströmning sekvensering (chip-seq)
check_url/53620?article_type=v

Kombinera enda molekyl manipulation och Imaging för studier av protein-DNA-interaktioner
check_url/53620?article_type=v

Mycket effektiv Ligering av små RNA-molekyler för MicroRNA Kvantifiering av hög genomströmning sekvense
check_url/53620?article_type=v

Riktade DNA-metylering analys av Nästa generations sekvense
check_url/53620?article_type=v

Hög kapacitet Screening för kemiska modulatorer av Post-transkription Reglerade Gener
check_url/53620?article_type=v

Kromatin Immunoprecipitation analys för identifiering av Arabidopsis Protein-DNA-interaktioner<em> In Vivo</em

Read Article