DNAメチル化解析のためのゴールドスタンダードは、重亜硫酸変換したDNAのゲノム配列決定です。このメソッドは、酸性条件下で脱アミノ化を亜硫酸、5 - メチルシトシン(5 - MEC)と比較しシトシンの感度の向上を活用しています。非メチル化シトシンを標的ゲノムDNAのPCR増幅後にメチル化シトシンを区別することができます。