Хотя переваривание белков, углеводов и липидов может начаться в желудке, оно завершается в кишечнике. Поглощение питательных веществ, воды и электролитов из пищи и питья также происходит в кишечнике. Кишечник можно разделить на два структурно различных органа – тонкий и толстой кишки.
Тонкая кишка представляет собой трубку длиной ~ 22 метра с внутренним диаметром всего 2,5 см. Поскольку здесь всасывается большинство питательных веществ, внутренняя оболочка тонкой кишки очень извилистая и покрыта пальцами, называемыми ворсинками, каждая из которых содержит сотни микроворсинок. Складки, ворсинки и микроворсинки тонкой кишки увеличивают площадь абсорбции в 60–120 раз. Увеличенная площадь поверхности дает хорошие возможности для усвоения питательных веществ.
Тонкая кишка соединяется с желудком пилорическим сфинктером, который закрывается, когда химус попадает в двенадцатиперстную кишку – начало тонкой кишки. Средняя и самая большая часть тонкой кишки – тощая кишка. Подвздошная кишка заканчивается тонкой кишкой, где она прикрепляется к толстой кишке с помощью илеоцекального клапана.
Толстый кишечник начинается от слепой кишки. Аппендикс, небольшая лимфатическая структура, свисает со дна слепой кишки. Выше слепой кишки начинается восходящая ободочная кишка, за которой следует поперечная ободочная кишка. Они поглощают большую часть оставшейся воды и электролитов из химуса, превращая его в кал. Нисходящая ободочная, сигмовидная и прямая кишки хранят фекалии до тех пор, пока они не будут выведены через задний проход.
В целом толстая кишка имеет длину около 1,5 м и внутренний диаметр 4,8 см. Он не содержит складок и ворсинок, но абсорбирующие эпителиальные клетки имеют микроворсинки. В толстой кишке обитает бактериальная экосистема, которая выполняет заключительные этапы пищеварения – расщепление целлюлозы и клетчатки – соединений, которые желудок и тонкий кишечник плохо приспособлены для обработки.
В толстом кишечнике содержится более 700 различных видов бактерий. Считается, что разнообразие бактерий связано с ожирением и развитием диабета 2 типа. У людей с ожирением меньше штаммов бактерий, чем у их коллег, не страдающих ожирением. Низкое бактериальное разнообразие также связано с инсулинорезистентностью. Бактериальная экосистема кишечника – биом кишечника – формируется вскоре после рождения, при этом у этих младенцев, находящихся на грудном вскармливании, развивается биом кишечника из бактерий, присутствующих в грудном молоке. После рождения биом человека формируется генетикой, диетой, возрастом, полом и иммунной системой человека. Внешние факторы, такие как диета, состояние здоровья, лекарства и географическое положение, также значительно влияют на сложность биома кишечника.