계통발생

계통발생(phylogeny)은 유기체 또는 유기체 집단의 진화적 다양화(evolutionary diversification)와 관련이 있습니다. 이름을 가진 유기체의 집단을 분류군(taxon; 복수형 taxa)이라고 부릅니다. 분류군은 다양한 진화적 계층에 걸쳐 있을 수 있습니다. 예를 들어 모든 새를 포함하는 집합(즉, Aves강의 생물로 구성)은 분류군이고, 모든 데이지종의 집합(즉, Bellis 속)도 분류군입니다. 마찬가지로 계통발생은 하나의 속(즉, 종 간의 관계를 묘사하기 위해)만 포함하거나 전체 계를 포함할 수 있습니다.

일반적으로, 계통발생은 나무(phylogenetic tree; 계통수)로 묘사됩니다. 각 관심 분류군(taxon of interest)은 분기(branch; 나뭇가지에 해당) 끝에 표시되어 있으며, 분기들은 분류군 간의 관계를 나타냅니다. 밀접하게 관련된 분류군은 유전체의 더 큰 부분을 공유하며, 형태학적 유사성을 야기합니다. 자매 분류군(sister taxa)은 서로 공유하는 분기점(node)으로 표시되는 직계 공통조상(immediate common ancestor)을 가지고 있습니다.

나무의 분기점은 분류군을 구별하는 형태학적 특성이나 분자 변화를 묘사합니다. 특정 분기점에 직접 연결되는 모든 분류군은 가장 최근 공통조상을 공유합니다. 따라서 나무의 뿌리는 나무의 모든 분류군이 공유하는 조상이 됩니다. 뿌리가 없는 나무는 분류군끼리의 관계를 나타내지만 공유된 공통조상에 대한 정보를 제공하지 않습니다.

나무 분기의 길이는 의미를 가질 수도 있고 가지지 않을 수도 있습니다. 길이가 조정된 나무의 분기 길이는 시간 또는 분류군이 공통조상에서 진화한 이후 발생한 변화 횟수를 나타낼 수 있습니다.