الإمراض البكتيري والتفاعلات مع المضيف

المصدر: يونغ، أ. ل. وآخرون. الحويصلات الغشية الخارجية لمرض Legionella pneumophila: عزل وتحليل إمكاناتها الالتهابية على البلعميات. J. Vis. Exp. (2017)يوضح هذا الفيديو عزل الحويصلات الغشائية الخارجية (OMVs) من Legionella pneumophila باستخدام الطرد المركزي التسلسلي، والترشيح المعقم، والطرد المركزي فوق الفائق. تعد الميكروفونات النقية النقية، الغنية ببروتينات الغشاء والدهون البوليسكاريدية، مناسبة لدراسات تفاعل المضيف والممرض.

ابدأ بأنابيب تحتوي على المرحلة المزمنة غير المتكاثرة، أو مرحلة NRP من متفطرة السل، والتي تحتوي على طبقة خارجية سميكة.أضف حبيبات زجاجية إلى أنبوب واحد وهزه لتعطيل الطبقة الخارجية للبكتيريا الميكانيكية بشكل ميكانيكي، مما يعزز نفاذية.بعد ذلك، انقل التعليق الفطري المضروب بالخرز إلى أنبوب جديد.أضف الريفامبيسين الموسوم بالفلورية، وهو مضاد حيوي مضاد للسل، إلى كل من معلقات الخلايا غير المعالجة والمصابة بالخرز.حضن الريفامبيسين الموسوم بالفلورسنت بالدخول إلى البكتيريا الفلورية.مع مرور الوقت، يدخل المزيد...

ابدأ بتعليق الإستروجين الممرض للطيور. القولون أو APEC في وسائط النمو.APEC هي بكتيريا سالبة الجرام تصيب الدواجن عن طريق دخولها عبر الجهاز التنفسي.بعد اختراق الطبقة المخاطية، يلتصق APEC بخلايا الظهارة، ويتكاثر محليا، ويعطل الحاجز الظهاري لدخول مجرى الدم. تنتشر البكتيريا بعد ذلك إلى عدة أعضاء، مما يسبب عدوى جهازية.أضف حجما متساويا من التعليق البكتيري إلى كل بئر من صفيحة متعددة الآبار تحتوي على تركيزات متزايدة من المضاد الحيوي إنروفلوكساسين.أغلق الطبق واحتضن في ظروف نمو بكتيرية مثالية.أثناء...

المصدر: سبيز، إ. إم. وآخرون، النمط ثلاثي الأبعاد للأفلام الحيوية الهندسية باستخدام طابعة حيوية تقوم بنفسك. تجارب ج. فيس. (2019)يوضح هذا الفيديو طريقة لمقارنة أنماط الألجينات المطبوعة ثلاثية الأبعاد التي تحتوي على سلالات بكتيرية محكمة أو معدلة وراثيا. تنتج السلالة التجريبية ألياف الكرلي عند الحث، والتي تعزز بنية الهيدروجيل الألجينات. بعد العلاج بمحلول مخلب الكالسيوم، يبقى نمط الاختبار فقط سليما، مما يبرز تأثير التثبيت لإنتاج ألياف الكيرلي.

المصدر: تاي، س. ب. وآخرون. الاضطراب المضاد للفيروس للأغشية الحيوية الممرضة باستخدام اللاكتوناز الهندسي لتبريد النصاب الطبيعي. J. Vis. Exp. (2016)يعرض الفيديو طريقة لقياس الكتلة الحيوية للغشاء الحيوي في بكتيريا ممرضة، حيث يقارن الضوابط غير المعالجين بالعينات التي عولجت بإنزيم لتبريد النصاب. يعطل الإنزيم الإشارات البكتيرية أثناء الحضانة المبكرة، مما يقلل من التصاق الخلايا. بعد الغسيل وزيادة الحضانة، تتكون آبار التحكم في الأغشية الحيوية الكثيفة، بينما تظهر الآبار المعالجة تكوينا أقل. يستخدم صبغة...

المصدر: شلافر، س، وفروست كريستنسن، م. مراقبة الرقم الهيدروجيني خارج الخلية في الأغشية الحيوية عبر المملكة باستخدام المجهر الكونفوكلي. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو زراعة الأغشية الحيوية المجمعة المشوهة وكانديدا ألبيكانس عبر المملكة تحت ظروف شبيهة بالفم لنمذجة التفاعلات البكتيرية-الفطرية، مما يمكن دراسة التآزر الميكروبي، والالتصاق بالجلوكان، والضراوة الحمضية في مسببات الأمراض الفموية.

المصدر: كورز، د. ل. وآخرون. منصة ميكروفلويدية لدراسة السد الحيوي في الأوساط المسامية. J. Vis. Exp. (2022)يوضح الفيديو استخدام جهاز ميكروفلويديك لدراسة تكوين الأغشية الحيوية. يتم إدخال تعليق بكتيريا في القناة الدقيقة، يتبعه الحضانة للسماح بتطور الأغشية الحيوية. ثم يستأنف التدفق، ويستخدم مراقبة الضغط مع التصوير لاكتشاف تكوين الغشاء الحيوي وانسداد المسام مع مرور الوقت.

المصدر: بيرينبام، ك.، وسيريابورن، أ. اختبار سريع للضراوة البكتيرية يعتمد على الصور باستخدام الأميبا. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو طريقة سريعة قائمة على الصور لتقييم ضراوة البكتيريا عن طريق حضانة الأميبات مع بكتيريا سطحية أو عوالقية، وتطبيق وسادة أغاروز من إستر كالسيتين-أسيتوكسي ميثيل (كالسيين-AM)، وتصوير الفلورة للكشف عن تلف خلايا المضيف.

المصدر: بوخر، ت.، وآخرون. منهجيات دراسة B . subtilis Biofilms كنموذج لتوصيف مثبطات الأغشية الحيوية للجزيئات الصغيرة. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو اختبار تكوين الحبيبات باستخدام Bacillus subtilis لتقييم مثبطات الجزيئات الصغيرة التي تعطل تخليق المصفوفة وتطور الأغشية الحيوية، موفرا نموذجا لفحص المركبات التي تثبط النمو المرتبط بالسطح بشكل انتقائي دون التأثير على الخلايا الطافية.

المصدر: بوخر، ت.، وآخرون. منهجيات دراسة B. subtilis Biofilms كنموذج لتوصيف مثبطات الأغشية الحيوية للجزيئات الصغيرة. J. Vis. Exp. (2016).يوضح هذا الفيديو كيف تؤثر سلامة مصفوفة الأغشية الحيوية على مقاومة البكتيريا للإيثانول من خلال مقارنة وحدات تكوين المستعمرات في الأغشية الحيوية غير المعالجة والمعرضة للمثبطات. تظهر الوحدات الخالية من الفروع الخالية في عينات المعالجة بالمثبطات أن المصفوفة خارج الخلية ضرورية لحماية الخلايا المدمجة في الأغشية الحيوية من الإجهاد المضاد للميكروبات.

المصدر: بودوين، ت.، وآخرون. تصور تأثيرات البلغم على تطور الأغشية الحيوية باستخدام نموذج زجاجي مغطى بغرفة. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو استخدام زجاج غطاء مغرف لدراسة تأثير عوامل البلغم المستخرجة من المريض على تطور الأغشية الحيوية البكتيرية.

ابدأ بتعليق بكتيري في وسط المغذيات.أضف التعليق إلى صفيحة متعددة الحفر واحتضنها.العناصر الغذائية في الوسط تساعد على نمو البكتيريا والارتباطها.تفرز البكتيريا الملتصقة مواد بوليميرية خارج الخلية تتكون من عدادات السكريات والبروتينات والحمض النووي لتشكيل طبقة من الغشاء الحيوي.اغسله عدة مرات باستخدام المخزن لإزالة البكتيريا غير المرتبطة.قلب الصفيحة لضمان إزالة السائل المتبقي من البئر والسماح للغشاء الحيوي بالتجف.عالج بمثبت للحفاظ على المكونات الخلوية للغشاء الحيوي.أضف صبغة كاتيونية ترتبط بالمكونات...

المصدر: هو، ي.، وآخرون. تحليل التفاعلات بين الإندوبيوتيكس وميكروبيوم الأمعاء البشرية باستخدام أنظمة التخمير في الحمام الصناعي. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو استخدام الكروماتوغرافيا ذات الطبقة الرقيقة (TLC) لتقييم تحلل السكريات الخارجية (EPS) بواسطة ميكروبيوتا البراز البشري. يتم فصل شظايا EPS في المواد الفائقة للتخمير بناء على الحجم والقطبية باستخدام TLC، ثم تصور كشرائط ملونة بعد التلوين الخاص بالكربوهيدرات.

المصدر: شوماخر، د.، وسوغارد-أندرسن، ل. تصوير الخلايا الحية الفلورية لدورة الخلايا الخضرية الكاملة للبكتيريا الاجتماعية بطيئة النمو Myxococcus xanthus. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو استخدام تصوير الخلايا الحية لتتبع أصول الكروموسومات الموسومة الموسومة بالفلورسنت أثناء انقسام الخلايا البكتيرية. يلتقط ديناميكيات فصل الكروموسومات باستخدام المجهر التباين الطوري والفلوري الزمني الصحيح.

المصدر: توكونو، ي. وآخرون، الكشف الكهروكيميائي لتأثير نظائر الديوتيريوم الحركية على نقل الإلكترونات خارج الخلية في شيوانيلا أونيدينسيس MR-1. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو تجميع وتشغيل نموذج مفاعل كهروكيميائي مصمم لمحاكاة تكوين الأغشية الحيوية على أسطح الأقطاب. التحفيز الكهروكيميائي المتحكم به يعزز التصاق الميكروبات، مما يؤدي إلى تطور تدريجي لطبقة بيولوجية أحادية الطبقة البكتيرية.

المصدر: ناجي، أ.، وآخرون. دراسة الإجهاد التأكسدي الناتج عن مجموعة التهاب الترث العقدي في التهاب العين العقدي العقدي. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو استخدام بروتين فلوري أخضر موسوم ب SKN-1 في C. elegans لمراقبة الإجهاد التأكسدي من خلال تتبع التألق الأخضر. تظهر الديدان المعرضة ل S. gordonii فلورة نووية قوية، مما يؤكد الإجهاد الناتج عن الممرض، بينما تظهر تلك التي تغذى الإشريكية القولونية فلورة خضراء منتشرة في السيتوبلازم، مما يشير إلى تنشيط SKN-1 ضئيل.

المصدر: نيلسن، ت. ب. وآخرون، نموذج استنشاق الفم الفموي في الفأر للالتهاب الرئوي البكتيري المرتبط بجهاز التنفس الصناعي والاكتساب في المستشفى. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو عملية نقل البكتيريا عبر البلعوم الفموي إلى رئتي فأر مخدر لتحفيز عدوى الرئة وتحفيز استجابة مناعية.

المصدر: تشاو، ك. وآخرون. نموذج في المختبر لدراسة تأثير العلاج الضوئي الديناميكي بحمض 5-أمينولفولينيك على الغشية الحيوية المجمعة العنقودية الذهبية . J. Vis. Exp. (2018)يعرض الفيديو بروتوكول العلاج الضوئي الديناميكي لتقييم التأثيرات المضادة للبكتيريا على الأغشية الحيوية البكتيرية الموجبة جرام. تنقسم الأغشية الحيوية إلى أربع مجموعات: اثنتان تحصلان على مادة تحسس ضوئية، واثنتان تتلقيان مخزن مؤقت. جميعها تحتضن في الظلام، تليها التعرض للضوء الأحمر لمجموعة واحدة معالجة بالمقدمات ومجموعة واحدة فقط من...

Source: Escudero, J. A., et.al. Testing the Role of Multicopy Plasmids in the Evolution of Antibiotic Resistance. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates how escalating cefazidime exposure is used to compare the survival of three E. coli strains with different copies of the ampicillin resistance gene. It shows that only the strain with a multicopy plasmid survives at higher drug levels, highlighting how increased gene copy number accelerates resistance evolution.

Source: Saragliadis, A., et al. Producing Gene Deletions in Escherichia coli by P1 Transduction with Excisable Antibiotic Resistance Cassettes. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates the phage-mediated transfer of donor DNA carrying an excisable antibiotic resistance cassette into Escherichia coli. The integrated cassette replaces the target gene via homologous recombination, resulting in a stable gene deletion.

Source: Claes, J., et al, In Vitro and In Vivo Model to Study Bacterial Adhesion to the Vessel Wall Under Flow Conditions. J. Vis. Exp. (2015).This video demonstrates a method for studying host-pathogen interactions using a micro-parallel plate flow chamber seeded with human primary endothelial cells. Following endothelial cell activation by an ionophore and perfusion with fluorescently labeled bacteria, the cells release von Willebrand factor (VWF), which binds bacterial adhesins under shear...

Source: Holt-Torres, P. S. et al. Evaluation of Antimicrobial Activities of Nanoparticles and Nanostructured Surfaces In Vitro. J. Vis. Exp. (2023)This video demonstrates the use of the focused-contact exposure method to evaluate the antibacterial activity of nanostructured surfaces. It outlines the steps involved in establishing direct contact between bacteria and the nanostructured surface, incubation, bacterial collection, and colony counting to assess viability.

Source: Dubois, V., et al. Identification of Virulence Markers of Mycobacterium abscessus for Intracellular Replication in Phagocytes. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates the procedure of co-culturing amoebae with mutant bacterial strains to evaluate their intracellular survival and identify virulence markers through differences in colony counts.

المصدر: ناغري، ن. وآخرون. بلعمة الخلايا البلعمية الحويخية وإزالة البكتيريا في الفئران. J. Vis. Exp. (2019).يوضح هذا الفيديو تقييم البلعمة التي توسطها مستقبلات المكملات باستخدام خلايا دم حمراء للأغنام مجهزة ب IgM والمكملة، تليها امتصاصها بواسطة بلاعم الفئران. يتم قياس مدى البلعمة من خلال قياس ناتج كروموجيني أزرق يتكون من أكسدة ديامينوفلورين المحفز بالهيموغلوبين.

المصدر: تشانغ، س.، وآخرون. مسار العدوى داخل الجمجمة تحت الشفيق لدراسة أدوار أغشية المكورات العقدية السويس في التهاب السحايا في نموذج عدوى الفأر. J. Vis. Exp. (2018).يوضح هذا الفيديو كيفية اكتشاف تعبير الجين المستهدف في دماغ فأر مصاب بالبكتيريا. يتم استخراج الحمض النووي الريبي، ومعالجته بإنزيم يحلل الحمض النووي، ثم ينسخ إلى cDNA. يتم تضخيم الحمض النووي القائم على الحمض النووي من خلال الدورة الحرارية باستخدام بادئات جينية محددة، بينما يرتبط صبغة مرتبطة بالحمض النووي المضخم، مما يصدر فلورة. يتم...

المصدر: رادولوفيتش، ك.، وآخرون. حقن بوليبوليسكاريد في الفئران لمحاكاة دخول المنتجات المشتقة من الميكروبات بعد اختراق الحاجز المعوي. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو إجراء خطوة بخطوة لحقن بوليبوليسكاريد (LPS) في الفئران داخل الصفاق لتحفيز الالتهاب الجهازي.

خذ على سبيل المثال زراعة خلايا الكلى الخنزيرية، حيث تم معالجة إحدى الزرعات مسبقا بمثبط يزيد من درجة الحموضة الليسوسومية، مما يعيق التحلل الذاتي والليسوزومي.أضف البكتيريا الممرضة وأجهزة الطرد المركزي لتعزيز الاتصال بين المضيف والممرض.يحتضن للسماح بغزو البكتيريا واستيعابه في الحويصلات الداخلية.تستهلك البكتيريا الداخلية مغذيات المضيف للتكاثر، مما يسبب الإجهاد الأيضي.هذا الإجهاد ينشط الالتهام الذاتي، حيث يتمدد غشاء اللعام الذاتي حول الحويصلة، مكولا الابتسامة الذاتية.في الخلايا غير المعالجة، يستهدف...

خذ زراعة ملتصقة ببلاعميات الفأر.تعامل مع الاختبار جيدا باستخدام مخزن يحتوي على Wnt5A، وهو جزيء إشارة، وجهاز التحكم باستخدام المخزن فقط.العدوى بممرض بكتيريا واحتضن.في خلايا الاختبار، ينشط Wnt5A سلسلة إشارات تعزز إعادة تنظيم الهيكل الخلوي لتعزيز امتصاص البكتيريا إلى البلعمة، بينما الخلايا الضابطة التي تفتقر إلى هذا الإشارة تستوعب عددا أقل من البكتيريا.اغسل البكتيريا غير المداخلة، ثم حضنه بوسط يحتوي على مضادات حيوية للقضاء على البكتيريا خارج الخلية المتبقية.تجهز إشارات Wnt5A البلعوم المحتوية على...

المصدر: في ج. ج. وآخرون. طبقات أحادية القولون البشرية لدراسة التفاعلات بين مسببات الأمراض والسرطانات المشتركة وظهارة الأمعاء المضيفة. J. Vis. Exp. (2019).يوضح هذا الفيديو إجراء زراعة خلايا ظهارية مشتقة من القولون على نظام ترانسويل مغطى بالكولاجين لتوليد طبقة أحادية منتجة للمخاط تحاكي الحاجز المعوي وتمكن من إجراء دراسات تفاعل المضيف مع الممرض.

المصدر: لوكينن، ه. وآخرون. نمذجة السل في فطريات الزرد البالغة المصابة بفطر الزرد. J. Vis. Exp. (2018).

المصدر: سيغال، ن.، وآخرون. تنقية الحمض النووي الريبي من الليستيريا مونوسيتوجينات المزروعة داخل الخلايا في خلايا البلاعمية. J. Vis. Exp. (2016)يظهر هذا الفيديو استخراج الحمض النووي الريبي من ليستريا مونوسيتوجينات معزولة من بلاعم الفأر المصابة. يحافظ البروتوكول على الحمض النووي الريبي، ويحلل الخلايا باستخدام الفينول-كلوروفورم والحرارة، ويفصل الحمض النووي الريبي عن طريق الطرد المركزي. الملح والإيثانول، مع الحضانة الباردة، يشجعان على ترسيب الحمض النووي الريبي. يلتقط الحمض النووي الريبي الناتج...

المصدر: فونيش، ب. وآخرون، تحليل التألق المناعي لتكوين حبيبات الإجهاد بعد التحدي البكتيري لخلايا الثدييات. J. Vis. Exp. (2017)يظهر هذا الفيديو إصابة الخلايا الظهارية بالبكتيريا الممرضة شيجيلا فليكسنيري والاستجابة الخلوية الناتجة عن المضيف. تعطل بروتينات المؤثر البكتيري ترجمة المضيف، مما يؤدي إلى تكوين عضيات بدون غشاء تسمى حبيبات الإجهاد، والتي تعكس استجابة الخلية التكيفية للعدوى.

ابدأ بمزرعة خلايا مناعية مصابة بالبكتيريا الممرضة التي تشكل أجساما داخلية داخلية.العدوى البكتيرية تعيق مسار تقديم المستضد في الخلايا المناعية.خذ الثقافة غير المصابة كدليل على التحكم.بعد ذلك، أضف مستضدا بروتين نموذجي وحضن الجسم.تقوم الخلايا المناعية باستواء ومعالجة وعرض الببتيدات المشتقة من المستضد النموذجي على جزيئات MHC-I.بعد الحضانة، اغسل الخلايا لإزالة أي مستضد غير معالج.ثبت الخلايا، ثم أضف عامل تبريد لتحييد المثبت.أدخل خلايا T المصممة CD8+ واحتضنها.تتعرف هذه الخلايا على شظية المستضد...

المصدر: تشيتريت، د.، وآخرون. تطبيق تصوير الخلايا الحية والتصوير المقطعي بالإلكترونات الباردة لتحديد الخصائص المكانية والزمنية لنظام إفراز الليجيونيلا الرئوية نقطة/ICM. J. Vis. Exp. (2020).يوضح هذا الفيديو تحضير وتصوير البكتيريا الممرضة الموسومة بالفلورية. يتم أولا تحضير وسائد الأغاروز ووضعها داخل إطار لاصق. يتم تطبيق تعليق من البكتيريا المعدلة وراثيا التي تعبر عن بروتين فلوري على الوسادة لتثبيت الخلايا. ثم يغلق الإطار بغطاء ويتم مراقبته تحت المجهر لالتقاط صور فلورية للبكتيريا.

المصدر: وينستون، ج. أ. وآخرون. نموذج الفأر المعالج بالسيفيبرازون لسلالة كلوستريديوم ديفيسيل R20291 ذات الصلة سريريا. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو إجراء تطعيم الفئران المعالجة بالمضادات الحيوية بأبواغ كلستريديوم ديفيسيل لإنشاء نموذج فأر للعدوى لدراسة المرض واستجابات المضيف.

المصدر: وينستون، ج. أ. وآخرون. نموذج الفأر المعالج بالسيفيبرازون لسلالة كلوستريديوم ديفيسيل R20291 ذات الصلة سريريا. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو قياس كمية كلوستريديوم ديفيسيل في عينات البراز من نموذج فأر مصاب باستخدام تقنيات الزراعة الانتقائية. يوضح إجراءات جمع العينات، والمعالجة اللاهوائية، والتخفيف التسلسلي، وتعداد المستعمرات لتقييم استعمار البكتيريا وتفاعلات المضيف مع الممرض.

Source: Berens, C. et al. Applying an Inducible Expression System to Study Interference of Bacterial Virulence Factors with Intracellular Signaling. J. Vis. Exp. (2015)This video demonstrates the use of immunoblotting to assess apoptosis inhibition by the bacterial effector protein CaeB in human cells. It outlines the steps for detecting apoptotic markers following doxycycline-induced expression of pro-apoptotic proteins in host cells expressing the effector.

Source: Yuan, Z., et al. Bronchoalveolar Lavage Exosomes in Lipopolysaccharide-induced Septic Lung Injury. J. Vis. Exp. (2018)This video demonstrates an in vivo mouse model for inducing and analyzing acute lung injury (ALI) using intraperitoneal administration of bacterial lipopolysaccharide. The inflammatory cascade triggered by alveolar macrophages and neutrophils leads to epithelial and endothelial barrier disruption, allowing fluid and immune cells to accumulate in the alveoli. Alveolar...

Source: Li, T., et al. Studying Effects of Cigarette Smoke on Pseudomonas Infection in Lung Epithelial Cells. J. Vis. Exp. (2020).This video demonstrates how cigarette smoke extract weakens antimicrobial defense in lung epithelial cells by reducing AMP production, leading to increased bacterial invasion. The procedure measures intracellular bacterial load to assess the impact of smoke exposure on host-pathogen interactions.

Source: Ahn, J. J., et al., Experimental Infection with Listeria monocytogenes as a Model for Studying Host Interferon-γ Responses. J. Vis. Exp. (2016)This video demonstrates the preparation of mouse splenocyte cultures from Listeria monocytogenes-infected mice for downstream cytokine analysis. It includes ex vivo bacteria-derived antigen stimulation and sample processing to study T cell responses.

Source: Barbero, A. M., et al. Fluorescence Assays for the Study of Mycobacterium tuberculosis Interaction with the Immune Receptor SLAMF1. J. Vis. Exp. (2025)This video demonstrates the procedure for labeling host immune receptors that bind bacterial surface antigens, enabling their detection through flow cytometry.

Source: Zhang, C. et al. Development and Assessment of Intracellular Infection Models for Staphylococcus aureus. J. Vis. Exp. (2025)This video demonstrates the quantification of intracellular survival of a methicillin-resistant bacterial pathogen in mouse peritoneal macrophages. It outlines the steps involved in infection, extracellular bacterial clearance, host cell lysis, and colony enumeration to assess bacterial survival within host macrophages.

Source: Gutiérrez, S., et al., Isolation of Salmonella typhimurium-containing Phagosomes from Macrophages. J. Vis. Exp. (2017)This video demonstrates the magnetic isolation of phagosomes containing biotin–streptavidin bead–coated bacteria from infected macrophages. The protocol includes buffer treatments, cell disruption, magnetic separation, and washing to yield purified phagosomes for analysis.

المصدر: ميلز، ب. وآخرون، الفحص البصري لمجسات بكتيرية جديدة على أنسجة الرئة البشرية خارج الجسم الحي بواسطة المجهر الليزري الكونفوكلي. J. Vis. Exp. (2017)يعرض هذا الفيديو تصويرا فوريا لمكورات العنقود الذهبية الموسومة بالفلورية في التعليق وأنسجة الرئة باستخدام مجهر فلوري الألياف الكونفوكية.

المصدر: نغ، ك. م.، تروبيني، سي. تصور تفاعلات ميكروبيوم الأمعاء مع المضيف عبر التهجين الفلوري في الموقع ، تلوين الليكتين، والتصوير. J. Vis. Exp. (2021).يوضح هذا الفيديو عملية التهجين بالفلورة في الموقع (FISH) لتلوين ميكروبيوتا الأمعاء داخل أنسجة أمعاء الفئران عن طريق تهجين المجسات الفلورية مع حمض الريبونوكلييك البكتيري (rRNA) وصبغ هياكل المضيف للتحليل المجهري.

المصدر: سيفا-جوثي، ج. أ. وآخرون، العدوى البكتيرية الفموية والتساقط في ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو إجراء مراقبة تساقط البكتيريا في ذبابة الفاكهة عن طريق نقل ذبابة مصابة عبر عدة أنابيب تحتوي على غذاء، واستعادة البكتيريا المتساقطة، وقياس المستعمرات القابلة للحياة من خلال التخفيف والتلوين المتسلسل.

المصدر: دي فريس، سي. آر. وآخرون، نموذج تطعيم متأخر لعدوى جرح زائف الزائفة المزمنة . J. Vis. Exp. (2020).يعرض هذا الفيديو تقنية تصوير متوهج حيويا لمراقبة تقدم العدوى البكتيرية في نموذج فأر حي. البكتيريا الممرضة التي تم هندستها باستخدام نظام الإبلاغ luxABCDE تصدر ضوءا في موقع العدوى، مما يسمح برؤية البكتيريا النشطة أيضيا. من خلال تصوير الفأر على مر الزمن، يمكن للباحثين تتبع ديناميكيات العدوى بشكل غير جراحي وقياس شدة الإشارات المضيئة الحيوية.

المصدر: شي، ج. وآخرون. فحص وتحديد مثبطات صوت الحمض النووي الريبي من المؤثرات المفرزة لممرضات النباتات. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو اختبار التسرب المشترك لتحديد بروتينات العامل الممرض التي تثبط إسكات الحمض النووي الريبي في نيكوتيانا بنثاميانا 16c. يتم توصيل مراسل فلوري وجين مؤثر مرشح إلى أوراق النبات عبر البكتيريوم. عادة، يؤدي كتم الحمض النووي الريبي إلى تدهور نصوص المراسلين، مما يقلل من الفلورة. تمنع المؤثرات المثبطة هذه الاستجابة، مما يحافظ على التألق. يقدم هذا الاختبار طريقة سريعة...

المصدر: نيو، إل.، وآخرون. تصور موت الخلايا الهلبية البلعمية أثناء العدوى الميكوبكتيرية في أجنة سمك الزرد عبر المجهر الحيوي. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو استخدام المجهر الكونفوكي داخل الحياة لتصوير موت الخلايا الليتية البلعمية في أجنة سمك الزرد بعد عدوى فطرية المارينوم .

المصدر: سيمان، ب. ج.، et.al. نموذج تصوير حديثي الولادة لتعفن البكتيريا سالب الجرام. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو عزل العدلات والخلايا الأحادية الالتهابية من طحال الفئران الوليدية وتطبيقها في اختبار قتل البكتيريا المتوهج. يشمل التفكك الميكانيكي، وتحليل خلايا الدم الحمراء، وإثراء الخلايا المعتمدة على الخرزات المغناطيسية، وحضانة البكتيريا، والحماية بالمضادات الحيوية. تشير قراءات التلميع الزمنية إلى استيعاب البكتيريا الأولي تليها إزالة مناعية.

المصدر: تشوي، ي. س. وآخرون. الكشف في الموقع عن البكتيريا داخل الأنسجة المدمجة في البارافين باستخدام مسبار DNA موسوم بالديجوكسين يستهدف 16S rRNA. J. Vis. Exp. (2015).يوضح هذا الفيديو الكشف الميداني عن البكتيريا في مقاطع أنسجة اللثة للفئران باستخدام مجسات DNA موسومة بالديجوكسين تستهدف الحمض النووي البكتيري. يتم حضن القسم مع المجس. تضاف الأجسام المضادة المقترقة بالفوسفاتاز القلوي الخاصة بالديجوكسين. يتم تعطيل الفوسفاتازات الداخلية، ويتم الحصول على ترسيب ملون عن طريق إضافة الركيزة. يتم صبغ المقطع...

المصدر: فالنتاين، م. إ.، وآخرون، توليد طفرات حذف الجينات داخل الإطار في سودوموناس aeruginosa واختبار تخفيف الضراوة في نموذج فأر بسيط للعدوى. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو استخدام نهج تصوير قائم على التلألؤ الحيوي لمراقبة العدوى البكتيرية في نموذج فأر حي. يتيح التصوير المتوهج البيولوجي والأشعة السينية التصوير في الوقت الحقيقي وتحديد مواقع تشريحية للعدوى المنتشرة في جميع أنحاء المضيف.

المصدر: لويتس، ن. وآخرون. المتابعة الطولية لالتهابات المسالك البولية وعلاجها في الفئران باستخدام التصوير التوهج الحيوي. J. Vis. Exp. (2021).يوضح هذا الفيديو تحفيز وتتبع عدوى المسالك البولية في نموذج فأر باستخدام إشريكية كولوم متوهجة حيويا تحقن في المثانة، حيث يحدث التصاق البكتيريا والغزو والتكاثر داخل الخلية. يعمل الضوء المنبعث من الأوبيرون المضيء الحيوي كمؤشر فوري على حمل البكتيريا أثناء تقدم العدوى.

المصدر: أوبراين، في. بي.، وآخرون، عدوى متكررة في المسالك البولية بسبب التعرض للمثانة المهبلية في الفئران . تجربة J. Vis. (2020)يوضح هذا الفيديو استخدام المجهر الإلكتروني الماسح لتصوير استعمار البكتيريا وتفاعلات المضيف مع الممرض في ظهارة المثانة لنموذج فأر مسبق العدوى.

المصدر: بيرنوت، أ.، وآخرون، فك وتصوير سبب وربط خراجات الفطر في أجنة سمك الزرد. ج. فيس. إكسبر. (2015).يوضح هذا الفيديو بروتوكول لعزل وقياس خراج الفطر الفطري عن جنين سمكة الزرد المصاب. يتضمن الإجراء قتل الجنين الرحيم، وتحلل الأنسجة، والتجانس لإطلاق البكتيريا، يليه الطرد المركزي وإعادة التعليق في مخزن خافض للتوتر السطحي. وأخيرا، يتم تخفيف التعليق البكتيري بشكل تسلسلي، وتغطيتها على الأجار المكملة بالمضادات الحيوية، وحضانها لتمكين تكوين المستعمرة وقياسها.

المصدر: بيرنوت، أ.، وآخرون. فك شفرة وتصوير مسببات الأمراض وربط خراج الفطر في أجنة أسماك الزرد. J. Vis. Exp. (2015)يوضح هذا الفيديو بروتوكولا يستخدم أجنة سمك الزرد المعدلة وراثيا تعبر عن بلاعم فلورية ومصابة بسلالة خرافية الفلورية لتصور التفاعلات بين المضيف والممرض. يكشف كيف يمكن الحبال خارج الخلية من التهرب المناعي، مما يعزز بقاء البكتيريا وتلف خلايا المضيف.

ابدأ بعينة ماء ملوثة من المحتمل أن تحتوي على القولون البرازي، بما في ذلك الإشريكية القولونية.إجراء تخفيف تسلسلي في الماء المقطر لتقليل العكارة والحمل الميكروبي.اخلط العينة المخففة المطلوبة مع وسط المغذيات وحملها في شريحة ميكروفلويدية.استخدم ترشيح الفراغ لالتقاط البكتيريا على غشاء داخل قناة السربنتين للشريحة.أضف وسط مغذي إلى الحجرة العلوية وحضن البكتيريا لتعزيز تعافي البكتيريا.استبدال الوسط بمحلول من فاجات خاصة بالإشريكية القولونية التي تحمل جين اللوسيفيراز.حضن للسماح بعدوى العشائم، حيث يتكرر...

المصدر: ماكوفسكي، ل.، وآخرون. تصوير الخلايا الحية لدورة حياة المفترس البكتيري Bdellovibrio بكتيريوفوروس باستخدام مجهر الفلورة الزمنية المتقطعة. J. Vis. Exp. (2020)يظهر هذا الفيديو تصوير التألق الزمني لبكتيريا Bdellovibrio وهو يفترس الإشريكية القولونية الثابتة تحت وسادة أغاروز، مما يتيح التصوير اللحظي للتكاثر داخل الخلايا وإطلاق النسل لدراسة الافتراس البكتيري وتفاعلات الممرض بين المضيف.

المصدر: تاي، س. ب.، et.al. الاضطراب المضاد للفيروس للأغشية الحيوية الممرضة باستخدام اللاكتوناز الهندسي لتبريد النصاب الطبيعي. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو عملية تثبيط تكوين الغشاء الحيوي من خلال إدخال إنزيم يعطل إشارات الخلايا البكتيرية. يمنع الإنزيم البكتيريا من إنتاج مواد بوليمرية خارج الخلية، مما يقلل من تطور الأغشية الحيوية على طبق صغير ذو قاع زجاجي. وأخيرا، يتم تصور بنية الغشاء الحيوي باستخدام الليكتينات الفلورية والمجهر الماسح بالليزر الكونفوكلي.

المصدر: كولينز، أ. ج. وآخرون، تأسيس الزراعة الثنائية المستقرة للسكاريا التعايشية من تجويف الفم. J. Vis. Exp. (2021)يوضح هذا الفيديو استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) للكشف عن البكتيريا السكرية في مزرعة ثنائية باستخدام أكتينومايسيس. يوضح البروتوكول تضخيم الحمض النووي والرحلان الكهربائي الهلام لتأكيد تفاعل مستقر بين المضيف والطفيلي.

المصدر: ماتيس، أ. ج. التصاق البكتيريا بأسطح النباتات تم قياسه في المختبر. J. Vis. Exp. (2018).يوضح هذا الفيديو تقييم ارتباط البكتيريا بجذور النبات باستخدام المجهر التباين بالطور. يتم أولا تركيب عينات الجذور من الشتلات التي تم حضنها بالبكتيريا للتحقق من وجود البكتيريا الحرة. ثم تغسل العينات لإزالة البكتيريا المتراكمة بشكل فضفاض وتعاد تركيبها باستخدام غطاء مناسب لمنع التلف. وأخيرا، يتم عد عدد البكتيريا المرتبطة بشعيرات الجذور تحت المجهر.

المصدر: ماتيس، أ. ج. التصاق البكتيريا بأسطح النباتات تم قياسه في المختبر. J. Vis. Exp.، (2018)يوضح هذا الفيديو بروتوكولا لقياس استعمار جذور شتلات الطماطم بواسطة البكتيريا الممرضة البرية وذات البكتيريا الممرضة التي تفتقر إلى السليلوز. تظهر أعداد البكتيريا المثبتة بإحكام التصاقات أكبر وتكوين مستعمرات دقيقة بواسطة السلالة البرية، مما يبرز دور السليلوز في استقرار الجذور.

المصدر: براون، أ. أو.، وأوريويلا، سي. جي. تصور المكورات العقدية الرئوية داخل الآفات القلبية الدقيقة وإعادة تشكيل القلب اللاحقة. J. Vis. Exp. (2015)يظهر الفيديو صبغ مناعية لأقسام أنسجة القلب الكيميائية في الفأر لرؤية البكتيريا الممرضة الموضعية داخل الآفات الدقيقة الناتجة عن العدوى. تشمل العملية غسل الأنسجة، ونفاذية الغشاء، وحجب المواقع غير المحددة، وتصنيف الأجسام المضادة، والتلوين المضاد النووي، والمجهر الكونفوكالي للكشف عن تجمعات البكتيريا وتحديد موقعها.

المصدر: سبيكر، ج. ت. وآخرون. دراسة التعاون الميكروبي من خلال تحليل التصوير الطيفي الكتلي لمستعمرات البكتيريا التي نمت على الأجار وفي الأنسجة أثناء العدوى. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو استخدام مطيافية الكتلة بمساعدة المصفوفة بالليزر المدعوم بالمصفوفة (MALDI) لرؤية توزيع الأحماض الأمينية في أنسجة الأمعاء من فئران مصابة بكلوستريدويد ديفيسيل، بمفردها أو مع مجمع مع المكمكس المعوية الفارزية. تتضمن العملية تحضير الأنسجة، وتطبيق المصفوفة، وتأين الليزر، واكتشاف أيونات الأحماض الأمينية لتوليد صور...

المصدر: بوخر، ت.، وآخرون، منهجيات دراسة أغشية B. subtilis كنموذج لتوصيف مثبطات الأغشية الحيوية للجزيئات الصغيرة. J. Vis. Exp.(2016)يوضح هذا الفيديو تحضير مستعمرات الأغشية الحيوية البكتيرية الناضجة للتصوير عالي الدقة. يغطي خطوات التثبيت، والتجفيف، والتثبيت، وطلاء المعادن للحفاظ على شكل الأغشية الحيوية وتصورها.

المصدر: بودوين، ت.، وآخرون. تصور تأثيرات البلغم على تطور الأغشية الحيوية باستخدام نموذج زجاجي مغطى بغرفة. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو طريقة في المختبر لتقييم كيف يؤثر البلغم الناتج عن التليف الكيسي المستخرج من المريض على تكوين الأغشية الحيوية البكتيرية. باستخدام شرائح الحجرة، والتلوين الفلوري، والمجهر الكونفوكي، يكشف عن زيادة السماكة، وتغيير الهيكل، والكتلة الحيوية الأعلى في الأغشية الحيوية المزروعة بالبلغم، مما يبرز دور مكونات المضيف في تشكيل تطور الأغشية الحيوية.

خذ الأنابيب التي تحتوي على وسط يحتوي على مركب جسيمات نانوية، تم هندسته من مزيج من المعادن الانتقالية والكربون.إدخال البكتيريا الممرضة المقاومة للمضادات الحيوية من الجرام والسالبة في أنابيب منفصلة كعينات اختبار.يشمل البكتيريا غير المعالجة كمادة تحكم سلبية والبكتيريا المعالجة بالمضادات الحيوية كأداة تحكم إيجابية.حضن العينات مع هز.في البكتيريا سالبة الجرام، يسهل الغشاء الخارجي المسامي وطبقة البيبتيدوغليكان الرقيقة دخول الجسيمات النانوية، مما يؤدي إلى اضطراب الغشاء.ثم تحفز الجسيمات النانوية توليد...

المصدر: براتون، ب. ب. وآخرون، التصوير ثلاثي الأبعاد للخلايا البكتيرية لتمثيلات خلوية دقيقة وتحديد مواقع دقيقة للبروتين. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو الطريقة لالتقاط وتحليل صور الفلورة ثلاثية الأبعاد لخلايا البكتيريا لدراسة تنظيم البروتين على مستوى الخلية الواحدة.

المصدر: لي، ت. أ. ن. وآخرون، قياس تأثير البكتيريا والمواد الكيميائية على نفاذية الأمعاء لالتهاب الكاينورهابديتس الإليجان. J. Vis. Exp. (2019)يظهر هذا الفيديو اختبارا قائما على الفلورة لقياس نفاذية الأمعاء في C. elegans المعرضة لPseudomonas aeruginosa. مقارنة بالضبط الذي تم إطعام الإشريكية القولونية، تظهر الديدان المعالجة بالممرضات زيادة في تسرب الفلوروفور إلى تجويف الجسم، مما يشير إلى تلف الحاجز الظهاري.

المصدر: أوبراين، نائب الرئيس وآخرون. التهاب المسالك البولية المتكرر في الإشريكية القولونية ناجم عن تعرض المثانة المهبلية في الفئران. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو تحضير لقاح غاردنيلا المهبلي لإنشاء نموذج فأر لعدوى المسالك البولية المتكررة.

المصدر: لينهارد، أ. وآخرون. نموذج الفأر لانتقال المكورات الرئوية العقدية من مستعمرة إلى ممرض عند العدوى الفيروسية المشتركة يعيد المرض المتفاقم بسبب التقدم في العمر. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو نموذج عدوى مشتركة للفأر حيث يؤدي فيروس الإنفلونزا إلى انتقال المكورات الرئوية العقدية من مستعمرة إلى مسبب مرض. يوضح الخطوات المتضمنة في استعمار البكتيريا، والعدوى الفيروسية، وتطور الأمراض.

المصدر: لينهارد، أ.، وآخرون. نموذج الفأر لانتقال المكورات الرئوية العقدية من مستعمرة إلى ممرض عند العدوى الفيروسية المشتركة يعيد المرض المتفاقم بسبب التقدم في العمر. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو معالجة رئتي فأر متصوب معا ببكتيريا ممرضة وفيروس. يسمح التقطيع، وتجانس، وتغطية نسيج الرئة بقياس كمية الحمل البكتيري، مما يشير إلى انتشار البكتيريا إلى الرئتين وشدة المرض.

المصدر: كروس، ت.، وآخرون، تقنية إثراء محسنة لعزل أنواع عاثوم البكتيريا المفصلية من عزلات عينات التربة. J. Vis. Exp.(2015)يوضح هذا الفيديو تحضير مزرعة بكتيرية لإنتاج العاثيات البكتيرية. يغطي خطوات تلقيح بكتيريا التربة في قارورة محشوبة، وتعزيز النمو الموحد من خلال التهوية والهز، ومراقبة كثافة الخلايا باستخدام قياسات الكثافة البصرية. بمجرد أن تصل الزراعة إلى مرحلة النمو المثلى، تكون جاهزة لإنتاج بكتيريوفاج بكفاءة.

المصدر: كونوفر، م. س. وآخرون، تأسيس وتوصيف التهابات المسالك البولية وCAUTI في نموذج فأر. J. Vis. Exp. (2015)يوضح هذا الفيديو كيفية اكتشاف المجتمعات البكتيرية داخل الخلايا (IBCs) في نسيج المثانة المصابة بالإشريكية القولونية التي تعبر عن β-جالاكتوزيداز. بعد تثبيت الأنسجة، والنفاذ، والتلوين ب X-gal، تظهر خلايا IBC كبونكتا زرقاء تحت المجهر التشريح، مما يؤكد غزو بكتيريا أثناء عدوى المسالك البولية.

المصدر: وانغ، ي.، وآخرون. في الحياة دراسة العلاج بالضوء الأزرق المضاد للميكروبات لعدوى الحروق المقاومة للأدوية متعددة Acinetobacter baumannii باستخدام التصوير التوهجي الحيوي. J. Vis. Exp. (2017)يوضح هذا الفيديو كيفية إثبات عدوى الحرق في نموذج الفأر عن طريق تطبيق كتلة نحاسية ساخنة تليها لقاح بكتيريا ممرض. تستعمر البكتيريا المصفوفة خارج الخلية المكشوفة وتشكل غشاء حيوي، مما يتيح دراسات تفاعلية بين المضيف والممرض في الجسم الحي.

المصدر: وانغ، ي.، وآخرون. في الحياة دراسة العلاج بالضوء الأزرق المضاد للميكروبات لعدوى الحروق المقاومة للأدوية متعددة Acinetobacter baumannii باستخدام التصوير التوهجي الحيوي. J. Vis. Exp. (2017)يوضح هذا الفيديو إجراء تصوير التهابات جروح الحروق في الفئران الملقحة بمادة Acinetobacter baumannii التي تحمل أوبيرونا مضيء حيويا. يوضح كيف ينتج أكسدة الركيزة المحفزة باللوسيفيراز ضوءا يتناسب مع الحمل البكتيري، مما يمكن من مراقبة تقدم العدوى في الوقت الحقيقي باستخدام نظام تصوير التلألؤ الحيوي.

المصدر: باربيرو، أ. م.، et.al. تحاليل الفلورة لدراسة تفاعل الفطر السلي مع مستقبل المناعة SLAMF1. J. Vis. Exp. ((2025)يوضح هذا الفيديو اختبارا قائما على الفلورة لدراسة التفاعل بين مستقبل البلاعم ومستضدات متفطرة السل . يتم حضن المستضدات الموسومة بالفلورية على غطاء الغطاء مع مستخلصات بروتين البلاعمية، ومرتبطة بالأجسام المضادة، ويتم رؤيتها من خلال إشارات فلورية متداخلة.

المصدر: لي، ج. وآخرون. تطوير نموذج لعدوى يرقات سمك الزرد لكلوستريديويديس ديفيسيل. ج. فيس. إكسب. (2020).يوضح هذا الفيديو إجراء الميكروغافاج، حيث يتم تثبيت يرقة سمك الزرد المخدرة في أغاروز وحقنها عن طريق الفم ببكتيريا ممرضة باستخدام إبرة موجهة بجهاز التتبع. يحاكي هذا التوصيل غير الجراحي العدوى الطبيعية، مما يمكن من تحليل تكاثر البكتيريا، وإفراز السموم، وتلف الظهارة المعوية.

المصدر: روفيان، ج. س.، et.al. تحليل خلية واحدة لتعبير جينات Pseudomonas syringae داخل نسيج النبات. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو طريقة تسرب بالتفريغ لإدخال ممرض بكتيري في أوراق نبات الأرابيدوبسيس . يستخدم هذا النهج تعليق بكتيري محضر ونبضات فراغية لتمكين دخول منتظم عبر الثغر، مما يؤدي إلى السيطرة على عدوى الأوراق.

المصدر: كازانوفا، أ.، وآخرون. اختبارات المجهرية لفحص العوامل المضيفة المتورطة في عدوى بروسيللا لخلايا هيلا عالية الإنتاجية. J. Vis. Exp. (2016)يظهر هذا الفيديو تصويرا عالي الإنتاجية لعدوى بروسيلا إبورتوس في الخلايا الطهارية مع تقليل STING بوساطة siRNA لدراسة دور استشعار الحمض النووي الخلوي في تكاثر البكتيريا داخل الخلية والاستجابة المناعية الفطرية للمضيف.

المصدر: ميكيل غينوك، سي، وآخرون. طريقة جديدة للتحليل النوعي متعدد المقاييس للأغشية الحيوية البكتيرية على مستعمرات الفطريات الخيطية باستخدام المجهر الكونفوكال والإلكتروني. J. Vis. Exp. (2017)يوضح هذا الفيديو تحضير مزرعة فطرية على أغشية السيلوفان المعالجة لدعم تكوين المستعمرة والنمو الكعبري. ثم يوضح زراعة وتحضير خلايا بكتيريا في التربة لإجراء اختبارات تفاعلية. وأخيرا، يوضح كيف تلتصق الخلايا البكتيرية بالمستعمرة الفطرية وتشكل طبقة حيوية، مما يمكن من دراسة تفاعلات البكتيريا والفطريات.

المصدر: هاريس، س. ل. وآخرون. مراقبة استعمار البكتيريا والحفاظ على جذور الأرابيدوبسيس ثاليانا في نظام الزراعة المائية العائمة. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو بروتوكولا لمراقبة استعمار البكتيريا المرتبطة بالجذر على شتلات الأرابيدوبسيس ثاليانا المزروعة في نظام بلا تربة. بعد الاستعمار، يتم إزاحة البكتيريا عن طريق التصويب، ثم تخفيفها، وتطلأها، وتحتضنها لتشكيل مستعمرات تعكس ارتباط البكتيريا وقابليتها للبقاء على قيد الحياة.

Source: Calatayud Arroyo, M., et al. Assessing the Viability of a Synthetic Bacterial Consortium on the In Vitro Gut Host-microbe Interface. J. Vis. Exp. (2018)The video demonstrates a method to evaluate the viability of anaerobic oral bacteria using fluorescent dyes and flow cytometry. It begins with culturing bacteria in oxygen-free broth, followed by resuspending a single colony from a blood agar plate. After incubation and dilution, the culture is stained with membrane-permeable and...

Source: Jackson, L., et al. Visualization of Pseudomonas aeruginosa within the Sputum of Cystic Fibrosis Patients. J. Vis. Exp. (2020)This video demonstrates the in situ visualization of Pseudomonas aeruginosa within chemically cleared cystic fibrosis sputum using fluorescent labeling and confocal microscopy to reveal bacterial localization and biofilm structure.

Source: Hunt, A. M. A., et al. Come to the Light Side: In Vivo Monitoring of Pseudomonas aeruginosa Biofilm Infections in Chronic Wounds in a Diabetic Hairless Murine Model. J. Vis. Exp.(2017).This video demonstrates the procedure for assessing infection clearance and healing progression in a wounded diabetic mouse using bioluminescent and microscopic images.

Source: Liu, X., et al. Bacterial Leaf Infiltration Assay for Fine Characterization of Plant Defense Responses using the Arabidopsis thaliana-Pseudomonas syringae Pathosystem. J. Vis. Exp. (2015).This video demonstrates a method to assess the bacterial load in Arabidopsis thaliana leaves infected with Pseudomonas syringae. Leaf discs from infected leaves are homogenized, serially diluted, and plated onto nutrient-rich agar to promote bacterial colony formation. Colony counts are then used to...

Source: Ahn, J. J., et al. Experimental Infection with Listeria monocytogenes as a Model for Studying Host Interferon-γ Responses. J. Vis. Exp. (2016)The video demonstrates bacterial load measurement in spleen and liver tissues isolated from mice infected with an intracellular bacterial pathogen. Bacteria, accumulated within tissue-resident phagocytes during systemic infection, are released using detergent-based lysis and mechanical disruption. Serial dilutions of the homogenates are plated on...

المصدر: سيفا-جوثي، ج. أ. وآخرون. العدوى البكتيرية الفموية والتساقط في ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر. J. Vis. Exp. (2018)يظهر الفيديو العدوى الفموية لذبابة الفاكهة الميلانوغاستر بالبكتيريا الممرضة. يشمل ذلك تحضير قوارير العدوى ونقل الذباب الجائع لتمكين ابتلاع البكتيريا. تلتقط العملية استعمار الأمعاء، تليها تعقيم السطح وتجانس الذباب. وأخيرا، يظهر قياس كمية الحمل البكتيري الداخلي من خلال التخفيف المتسلسل وعد المستعمرات.

المصدر: مولر، أ.، وآخرون. نموذج تجريبي لدراسة العدوى المشتركة بين السل والملاريا عند انتقال طبيعي للبكتيريا الفطرية السلية وبلازموديوم بيرغي. J. Vis. Exp. (2014)يوضح هذا الفيديو توصيل الفطر السلي (Mtb) عبر الرذاذ إلى الفئران باستخدام نظام حجري قائم على جهاز التنشيح لتحفيز العدوى الرئوية، موفرا نموذجا مضبوطا وقابلا للتكرار لدراسة انتقال السل الجوي وتفاعلات المضيف مع الممرض في الجسم الحي.

المصدر: دي فريس، سي. آر.، et.al. نموذج تلقيح متأخر لعدوى جرح زائفة aeruginosa المزمنة. J. Vis. Exp. (2020)يظهر هذا الفيديو التأخير في تلقيح Pseudomonas aeruginosa المتوهج في فأر يحمل جرحين جلديين كاملين مغطى بضمادة شفافة من الطبقة الظهرية. وهذا يسهل تكوين الأغشية الحيوية وتكوين العدوى المزمنة. تمكن المراقبة المنتظمة للتوهج الحيوي من قياس العبء البكتيري وتتبع تقدم العدوى مع مرور الوقت.

المصدر: ليو، إكس، وآخرون. اختبار تغذية بكتيري فموي باستخدام البعوض المعالج بالمضادات الحيوية. J. Vis. Exp. (2020)يظهر هذا الفيديو استنزاف ميكروبيوتا الأمعاء الأصلية في البعوض باستخدام محلول السكروز يحتوي على مضاد حيوي. يتبع ذلك إعادة استعمار محكومة مع تعليق بكتيريا يتم توصيله عبر نظام تغذية غشائي لتحديد مجموعة بكتيرية محددة في أمعاء البعوضة.

المصدر: سيمان، ب. ج.، وآخرون. نموذج تصوير حديثي الولادة لتعفن البكتيريا سالب الجرام. J. Vis. Exp. (2020)يعرض الفيديو نموذج فأر حديثي الولادة لدراسة العدوى الجهازية باستخدام بكتيريا مضيئة حيوية مغلفة. يتم حقن الجراء حديثي الولادة بجرعات عالية أو منخفضة من معلقات بكتيرية وتعاد إلى أمهاتهم للرعاية بعد الولادة. البكتيريا المغلفة تتجنب الكشف المناعي المبكر، وتنتشر بشكل نظامي، ويتم رؤيتها مع مرور الوقت باستخدام التصوير التلميعي. يتيح هذا النموذج تتبع تقدم العدوى بشكل غير جراحي لدى الفئران حديثة...

المصدر: شي، ج. وآخرون، فحص وتحديد مثبطات إسكات الحمض النووي الريبي من المؤثرات المفرزة لمسببات الأمراض النباتية. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو إجراء تحضير مزرعة Agrobacterium tumefaciens عن طريق تحفيز التعبير الجيني الضراوي باستخدام الأسيتوسيرينجون، ثم إزالة المضادات الحيوية عن طريق الغسل وإعادة التعليق، لتوليد تعليق جاهز للتحول لنقل الجينات إلى أنسجة النبات.

المصدر: بهيرا، ر.ك. وآخرون، طريقة قائمة على التألق لدراسة تنظيم جينات البكتيريا في الأنسجة المصابة. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو تحضير مزرعات المكورات العنقودية الذهبية المتحللة للدم لتوحيد نمو البكتيريا وتحقيق التزامن الأيضي لدراسات تفاعل المضيف مع الممرض.

المصدر: شي، ج. وآخرون، فحص وتحديد مثبطات إسكات الحمض النووي الريبي من المؤثرات المفرزة لمسببات الأمراض النباتية. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو إجراء تحضير مزرعة Agrobacterium tumefaciens عن طريق تحفيز التعبير الجيني الضراوي باستخدام الأسيتوسيرينجون، ثم إزالة المضادات الحيوية عن طريق الغسل وإعادة التعليق، لتوليد تعليق جاهز للتحول لنقل الجينات إلى أنسجة النبات.

المصدر: تشين، ي.، وآخرون. تقييم ضراوة ومسببات عدوى إيروموناس في نموذج التهاب الكاينورهابديتس الأمريكي . J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو اختبار البقاء باستخدام C. elegans لنمذجة مرض Aeromonas ، حيث يؤدي تناول البكتيريا عن طريق الفم إلى عدوى معوية ووفيات، مما يمكن من تقييم كمية لضراوة البكتيريا في نظام العائل الحي.

ابدأ بالفئران التي تعاني من نقص المناعة تحمل أورام زينوغرافات تحت الجلد مشتقة من خلايا سرطان القولون والمستقيم البشرية.أعط الفأر المعالج بكتيريا بيديوكوس بنتوساسيوس، وهي بكتيريا حمض اللاكتيك آمنة للاستهلاك ومصممة لإفراز بروتين مضاد للسرطان، عن طريق الفم.أعط المحلول الملحي لفأر التحكم.وبما أنها تتحمل الأحماض، تنجو البكتيريا من البيئة الحمضية للمعدة وتصل إلى الأمعاء.هناك، يستعمرون تجويف الأمعاء ويفرزون البروتين المضاد للسرطان.يتم امتصاص البروتين المفرز من قبل خلايا الظهارة المعوية عبر الالتداخل...

ابدأ بالفئران التي تحمل أوراما صلبة مزروعة تحت الجلد في الفخذ.حقن الفئران عبر الوريد الذيلي بسلالة غير مدمرة وهندسة من سالمونيلا تايفيموريوم.تدور البكتيريا في مجرى الدم وتتراكم بشكل انتقائي في البيئة الدقيقة للورم الناقص والمتناقض.تحمل بلازميدا يشفر ببتيد اندماج علاجي مكون من ببتيد مخترق الخلايا والمجال المستهدف الميتوكوندري لبروتين برو-أبوتوتيز، إلى جانب بروتينات التحلل المشتقة من الفاج.تنظم هذه الجينات بواسطة محفزات محفزة ل L-أرابينوز.إعطاء إل-أرابينوز داخل الصفاق لتحفيز التعبير الجيني...

المصدر: تشين، ي.، وآخرون. تقييم ضراوة ومسببات عدوى إيروموناس في نموذج التهاب الكاينورهابديتس الأمريكي. J. Vis. Exp. (2018).يوضح هذا الفيديو اختبار سمية السائل C. elegans باستخدام Aeromonas، وهي طريقة تستخدم لتقييم ضراوة البكتيريا عن طريق قياس بقاء الديدان في بيئة سائلة محدودة من حيث العناصر الغذائية. يكشف الاختبار عن ممرضية خاصة بالسلالة بناء على مدى الضرر الناتج عن السموم والوفيات في C. elegans.

المصدر: ناج، د.، وآخرون. قياس استيطان وإسهال Vibrio cholerae في نموذج سمك الزرد البالغ. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو بروتوكول لقياس الحمل البكتيري المعوي في أسماك الزرد البالغة المصابة بسلالة مقاومة للمضادات الحيوية من فيبريو كوليرا. بعد القتل الرحيم والتشريح، يتم عزل الجهاز الهضمي وتجانسه باستخدام خرز زجاجي، ومعالجته لإطلاق البكتيريا. يتم طلاء النظير المتجانس الناتج على وسط انتقائي، وتعد مستعمرات زرقاء اللون تعبر عن β-جالاكتوسيداز لتقدير العبء البكتيري.

المصدر: ناج، د.، et.al. قياس استيطان وإسهال Vibrio cholerae في نموذج سمك الزرد البالغ. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو تطعيم سمك الزرد البالغ بسلالة فيبريو كوليرا الممرضة لدراسة استعمار الأمعاء ونتائج الأمراض. يظهر كيف تعطل السموم البكتيرية سلامة الأمعاء، مما يؤدي إلى تسرب السوائل، وإفراز المخاط، والإسهال المائي قبل تجهيز الأسماك لمزيد من التحليل.

المصدر: باتراس، ك. أ.، دوران، ك. س. نموذج فأر لاستعمار المكورات العقدية من المجموعة ب. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو تحضير وتلقيح فأر أنثى عولجت بالهرمونات مصابة بالمكورات العقدية من المجموعة B لنمذجة العدوى. يشرح كيفية زراعة وتحضير البكتيريا، وإعطاء اللقاح في التجويف المهبلي، وضمان نجاح العدوى.

المصدر: باتراس، ك. أ. & دوران، ك. س. نموذج فأر لاستعمار المكورات العقدية من المجموعة ب. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو قياس كمية حمل المكورات العقدية من المجموعة B المهبلية (GBS) في نموذج فأر باستخدام المسحة والزراعة الكروموجينية. يوضح الخطوات المتبعة في جمع العينات، ووضع الدروع، وعد المستعمرات لقياس حمل متلازمة GBS في تجويف المهبل في الفأر.

المصدر: كونوفر، م. س. وآخرون، ج. تأسيس وتوصيف التهابات المسالك البولية وCAUTI في نموذج الفأر. J. Vis. Exp. (2015)يوضح هذا الفيديو عملية تجميع وزرع قسطرة عبر الإحليل في فأرة أنثى، تليها التلقيح البكتيري لتحديد عدوى المسالك البولية المرتبطة بالقسطرة ودراسة التفاعلات بين المضيف والممرض بواسطة الفيلم الحيوي.

المصدر: فلوريس، إي. وآخرون. باستخدام البروتوزوان Paramecium caudatum كوسيلة للعدوى المنقولة عن طريق الغذاء في يرقات سمك الزرد. J. Vis. Exp. (2019).يوضح هذا الفيديو طريقة إنشاء نموذج عدوى بكتيرية معوية عبر الغذاء في يرقات سمك الزرد من خلال إطعامها الباراميسيا المصابة بالإشريكية الفلورية الفلورية.

المصدر: وانغ، ي.، وآخرون. التحقيق الحي: العلاج بالضوء الأزرق المضاد للميكروبات لعلاج التهابات الحروق المقاومة للأدوية متعددة Acinetobacter baumannii باستخدام التصوير الحيوي التلألئ. J. Vis. Exp. (2017)يوضح هذا الفيديو الإجراء لعلاج التهابات جروح الحروق الناتجة عن البكتيريا المقاومة للأدوية المتوهجة حيويا في الفئران باستخدام العلاج بالضوء الأزرق، يليه تصوير التوهج الحيوي لمراقبة فعالية العلاج.

المصدر: ديتكوفسكي، ب.، وآخرون. نموذج في المختبر لنظام تروية موازية لدراسة التصاق البكتيريا بأنسجة الطعم. J. Vis. Exp. (2019).يوضح هذا الفيديو طريقة استخدام غرفة تدفق الصفائح المتوازية لدمج البكتيريا الموسومة بالفلورية فوق أنسجة الطعم الوعائي، مما يمكن من تحليل التصاق البكتيريا وبداية المرض تحت ظروف تدفق القص.

المصدر: بيرنينك، ب. م. وآخرون. التلقيح المباشر لشتلات الذرة عن طريق الحقن بفيروس فسيفساء ذيل الثعلب المؤتلف وفيروس فسيفساء قصب السكر المستنسخ المعدية. J. Vis. Exp. (2021)يوضح هذا الفيديو توصيل النسخ الفيروسية المؤتليفة بواسطة الزراعة البكتيريا إلى شتلات الذرة لإسكات الجينات. يوضح عملية عدوى البكتيريا الزراعية ، وانتشار الفيروسات الجهازية، والتغيرات الظاهرية الناتجة عن تداخل الحمض النووي الريبي.

المصدر: جوبتا، ك.، وآخرون. حقن الكلوية لمرض الإشريكية القولونية في نموذج فأر لالتهاب الحنجرة الجنونية. J. Vis. Exp. (2017).يوضح هذا الفيديو حقن الإشريكية القولونية داخل الكلى في حوض الكلى لفأر مخدر لتحفيز عدوى كلى موضعية، مستوحى من التهاب الحوضاء الكلى الحاد. تسلط الضوء على الخطوات الجراحية الرئيسية والتقنيات المعقمة اللازمة لإنشاء نموذج عدوى في الجسم الحي قابل للتكرار للتحليل اللاحق.

المصدر: بهيرا، ر. ك. وآخرون. طريقة قائمة على الفلورة لدراسة تنظيم جينات البكتيريا في الأنسجة المصابة. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو طريقة لتحضير أنسجة كلوية الفئران المصابة، وتلوين الحمض النووي، واكتشاف تعبير جينات البكتيريا باستخدام مراسلين فلوريين مزدوجين. الأحمر يحدد جميع البكتيريا، واللون الأخضر يبرز الخلايا المستجابة للعدوى.

المصدر: برزوزوفسكي، ر. س. وآخرون. المجهر الفلوري للخلايا الحية لدراسة مواقع البروتينات تحت الخلية وتغيرات شكل الخلايا في البكتيريا. J. Vis. Exp. (2019)يعرض هذا الفيديو مجهر فلورة الخلايا الحية لرؤية التغيرات الشكلية في الوقت الحقيقي للبكتيريا. يوضح الخطوات المتضمنة في التصوير، واكتساب التايم لابس، وفك الالتفاف للحصول على صور عالية الدقة في الوقت الحقيقي.

المصدر: ماكمولين، ب. د.، فريتاغ، ن. إي. تقييم الغزو البكتيري لخلايا القلب في الزراعة واستعمار القلب في الفئران المصابة باستخدام ليستيريا مونوسيتوجينات. J. Vis. Exp. (2015)يظهر هذا الفيديو حقن ليستيريا مونوسيتوجينس في وريد ذيل الفأر لتأسيس عدوى جهازية. يظهر الدورة الدموية البكتيرية، واستعمار الأعضاء، وقياس الحمل البكتيري في القلب عن طريق توحيد الأنسجة، وإجراء التخفيف المتسلسل، وتغليف الطبقات.

المصدر: زان، ي.، وآخرون. يتيح التبييض الضوئي التصوير فائق الدقة لحلقة FtsZ في بكتيريا الزرقاء بروكلوروكوكوس. J. Vis. Exp. (2018).يوضح هذا الفيديو إجراء تبييض الصبغات الضوئية في الخلايا الزرقاء باستخدام ضوء الزينون تحت ظروف باردة لتحسين تصوير الفلورة للبروتينات المنظمة للنمو.

المصدر: تشانغ، م. وآخرون، اختبار الحساسية السريعة لمضادات الميكروبات بواسطة تصوير تشتت رامان المحفز لدمج الديوتيريوم في بكتيريا واحدة. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو تطبيق مجهر رامان المحفز للتشتت لتقييم القابلية للمضادات الحيوية من خلال تتبع النشاط الأيضي الموسوم بالديوتيريوم. من خلال مراقبة إشارات الكربون-ديوتيريوم، تتيح الطريقة الكشف السريع عن مجموعات البكتيريا المقاومة والمعرضة للتأثير.

المصدر: هيروياسو، أ.، د وآخرون، استخراج الخلايا الدموية من يرقات ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر لإجراء العدوى الميكروبية وتحليلها. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو عملية إثبات العدوى البكتيرية في يرقات ذبابة الفاكهة عن طريق وضعها في قطرة بكتيرية ووخزها بإبرة التنجستن. ثم تحضن اليرقات على صفيحة أجار مثقبة غنية بالمغذيات لدراسة التفاعلات بين المضيف والممرض.

المصدر: هيروياسو، أ.، وآخرون. استخراج الخلايا الدموية من يرقات ذبابة الفاكهة الميلانوغاستر لإجراء العدوى الميكروبية وتحليلها. J. Vis. Exp. (2018)يعرض هذا الفيديو تصويرا كونفوكاليا عالي الدقة لخلايا الدم الميلانوغاستر من ذبابة الفاكهة المصابة بكوكسييلا بورنيتي لتصوير موقع الممرض ثلاثي الأبعاد، مما يتيح تحليلا تفصيليا لديناميكيات العدوى داخل الخلايا وتفاعلات المضيف مع الممرض.

المصدر: روفيان، ج. س. وآخرون. تحليل خلية واحدة لتعبير جينات Pseudomonas syringae داخل نسيج النبات. J. Vis. Exp. (2022).يوضح هذا الفيديو طريقة لتحليل تعبير الجينات في البكتيريا الممرضة المستخرجة من النباتات على مستوى الخلية المفردة باستخدام عامل نسخ مميز بالفلورية. يكشف التصوير الكونفوكالي عن عدم تجانس في تعبير جينات الضراوة، مما يبرز التنوع الوظيفي داخل مجموعة بكتيرية مستنسخة.

Source: Montefusco-Pereira, C. V. et al. P. aeruginosa Infected 3D Co-Culture of Bronchial Epithelial Cells and Macrophages at Air-Liquid Interface for Preclinical Evaluation of Anti-Infectives. J. Vis. Exp.(2020)This video demonstrates a co-culture model of bronchial epithelial cells and macrophage-like cells at the air-liquid interface to study host-pathogen interactions. Pathogenic bacterial infection compromises epithelial membrane integrity, triggering macrophage-like cell activation and...

Source: Nguyen, J. Q., et. al. Intratracheal Inoculation of Fischer 344 Rats with Francisella tularensis. J. Vis. Exp. (2017)This video demonstrates the procedure of intratracheal inoculation in an anesthetized rat, involving catheter placement, bacterial delivery into the trachea, and subsequent lung infection establishment for studying host-pathogen interactions.

Source: Claes, J., et al, In Vitro and In Vivo Model to Study Bacterial Adhesion to the Vessel Wall Under Flow Conditions. J. Vis. Exp. (2015).This video demonstrates an in vivo method for analyzing shear-dependent bacterial adhesion in a live mouse model. Following surgical preparation and catheterization, the mesenteric vasculature is exposed for real-time imaging under a fluorescence microscope. Perfusion with an ionophore and fluorescently labeled bacteria reveals how shear stress triggers...

Source: Poore, K., et al. Epithelial Cell Infection Analyses with Shigella. J. Vis. Exp. (2024)This video demonstrates an in vitro assay to assess Shigella invasion and intracellular replication in human colonic epithelial monolayers. It highlights steps for infection, antibiotic selection, host cell lysis, and recovery of intracellular bacteria for downstream analysis.

Source: Zhang, C., et al., Development and Assessment of Intracellular Infection Models for Staphylococcus aureus. J. Vis. Exp. (2025)The video demonstrates the isolation of kidneys containing Staphylococcus aureus-infected macrophages, followed by tissue homogenization to release intracellular bacteria. It quantifies bacterial persistence within macrophages in control and antibiotic-treated groups by counting colony-forming units.

Source: Berthold, A., et al. Cultivation Methods of Spirochetes from Borrelia burgdorferi Sensu Lato Complex and Relapsing Fever Borrelia. J. Vis. Exp.(2022)This video demonstrates the cultivation of pathogenic spirochetes from infected skin tissue to model dermal infection. It highlights their localization in the dermis, interaction with the extracellular matrix, and survival during selective culture conditions.

المصدر: مورغان، إي. وآخرون. التنظيف الانتقائي لديدان التهاب القيرغ البرية لإثراء بكتيريا ميكروبيوم الأمعاء. J. Vis. Exp. (2021)يوضح هذا الفيديو بروتوكولا لعزل البكتيريا المعوية محل الاهتمام من ديدان التهاب القيران البري. يتم أولا تجويع الديدان وغسلها للقضاء على البكتيريا المتبقية من سطحها وأمعاءها مع الحفاظ على الميكروبات المستهدفة. بعد تنظيف السطح وخطوات الزحف المتعددة، يتم تشريح الديدان لاستخراج الأمعاء التي تحتوي على البكتيريا المعنية، والتي تجمع ثم تجمد للتخزين.

المصدر: بيترسن، سي. وآخرون، عزل وتوصيف الميكروبيوتا الطبيعية لنموذج الديدان الخيطية Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (2022)يوضح هذا الفيديو عزل وزراعة الأنواع البكتيرية المرتبطة بمرض Caenorhabditis elegans. يمكن التحلل القائم على الخرزات ل C. elegans، يليه الزراعة الانتقائية، عزل السلالات الميكروبية المتنوعة لمزيد من التحليل.

المصدر: ليو، إكس، وآخرون. اختبار تغذية بكتيري فموي باستخدام البعوض المعالج بالمضادات الحيوية. J. Vis. Exp. (2020)يوضح هذا الفيديو تشريح الأمعاء الوسطى للبعوض لعزل بكتيريا الأمعاء. يتم استخراج الأمعاء الوسطى من الجهاز الهضمي، ويتم تجانسها لإطلاق البكتيريا، ثم تغطى على أجار المغذي لزراعة مستعمرات البكتيريا.

خذ فأر تحكم بميكروبيوتا أمعاء طبيعية وفأر تجريبي يعاني من ميكروبيوم أمعاء مستنفد. يؤثر هذا الاستنزاف على سلامة حاجز الأمعاء.وهذا يمكن البكتيريا من الانتقال عبر الوعاء الدموي إلى نسيج الكبد.حقن كلا الفأرين بفيروس التهاب الكبد B أو بلازميد فيروس HBV لتحفيز عدوى فيروس HBV في نسيج الكبد.في الفأر الضابط، تكتشف الخلية التائية خلية كبد مصابة من خلال تفاعل مستقبلاتها مع المستضدات الفيروسية، وتنتج سموما للخلايا لتحفيز موت الخلايا.في الفأر التجريبي، تطلق البكتيريا المنقولة من الأمعاء مستقلبات تتفاعل مع...

ابدأ بزراعة مستشعر بيولوجي بكتيريا معلقة في وسط.تنتج هذه البكتيريا الهندسة عامل نسخ، وعند ارتباطه باستيض براز محدد، ينشط محفزا مرتبطا بجين تقرير فلوري.أضف إلى هذه الثقافة عينة من فضلات بشرية مصفاة تحتوي على مستقلبات مثل اللاكتات التي تشارك في تفاعلات المضيف والميكروبيوم.قم بتخفيف هذا الخليط بوسط جديد للحفاظ على حجم تفاعل مثالي.حضانة الحوض دون ارتجافة لمحاكاة بيئة الأمعاء البشرية.تنتشر مستقلبات البراز في الخلية البكتيرية وترتبط بعامل النسخ.يرتبط هذا المركب بالمحفز ويؤدي إلى تعبير جين المراسلين...

ابدأ بنموذج جرذ مع خياطة مربوطة حول أسنانه العلوية لدعم استعمار البكتيريا.قم بوضع بكتيريا ممرضة فموية تسبب أمراض اللثة على الغرز بشكل متكرر باستخدام محلول يشبه الهلام.تستعمر البكتيريا اللثة حول الغرز.الاستعمار يسبب الالتهاب ويتلف الأنسجة.تفرز البكتيريا سموما تنتشر عبر الأنسجة التالفة وتدخل مجرى الدم.تصل هذه السموم المنتشرة إلى الأمعاء، وتسبب الالتهاب، وتعطل الحاجز الطلائي، وتزيد من نفاذيته.تدخل السموم بيئة الأمعاء وتقتل البكتيريا المفيدة.هذا يدعم نمو البكتيريا الممرضة، مما يغير توازن ميكروبيوم...

المصدر: يانغ، إي. وآخرون. عزل المجتمعات البكتيرية المفردة داخل الخلية الناتجة عن نموذج فأر لعدوى المسالك البولية لتحليل خلية واحدة لاحقا. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو العزل اليدوي لخلايا الظهارة المفردة التي تحتوي على مجتمعات بكتيرية داخل الخلية من مثانة الفأر المصابة باستخدام الميكروبايبينج الفمي، مما يتيح التحليل اللاحق لخلايا واحدة لتجمعات الإشريكية القولونية المرتبطة بالمضيف في نماذج عدوى المسالك البولية.

المصدر: تشين، ي. وآخرون، تقييم ضراوة ومسببات عدوى إيروموناس في نموذج التهاب الكاينورهابديتس الغريب . J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو اختبار نخر العضلات في C. elegans (Caenorhabditis elegans) باستخدام سلالات Aeromonas الممرضة. من خلال تغذية الديدان التي تعبر عن البروتين الفلوري الأخضر (GFP) على ألواح بذور Aeromonas، يحاكي الاختبار العدوى البكتيرية ويكشف عن تلف الأنسجة من خلال التصوير الفلوري. يشير فقدان البنية العضلية وإشارة GFP التدريجي إلى استجابة نخرية ناتجة عن إيروموناس.

المصدر: هو، ي. et.al.، تحليل التفاعلات بين الإندوبيوتيك وميكروبيوم الأمعاء البشرية باستخدام أنظمة التخمير في الحمام الصناعي. J. Vis. Exp. (2019)يوضح هذا الفيديو تحليل إنتاج الأحماض الدهنية قصيرة السلسلة بواسطة ميكروبيوتا الأمعاء البشرية استجابة للسكريدات الخارجية البوليسكاريدية. يبرز هذا فصل وقياس منتجات التخمير الميكروبي باستخدام كروماتوغرافيا الغاز. تكشف النتائج أن السكريات الخارجية تعدل المستقلبات الميكروبية التي تؤثر على ديناميكيات المضيف والممرض في الأمعاء.

المصدر: لو، ب. س. وآخرون. تليف معوي ناتج عن عدوى السالمونيلا المزمنة. J. Vis. Exp. (2019)يوضح الفيديو قياس كمية الحمل البكتيري في نموذج فأر للعدوى المزمنة بسالمونيلا تايفيموريوم المقاومة للستربتوميسين. بعد القتل الرحيم والتشريح المعقم، يتم جمع الأنسجة المخية والطحالية، وتحاقد بحبيبات فولاذية لإطلاق البكتيريا، وتخفيفها بشكل متسلسل. يتم طلاء التخفيفات على الأجار الانتقائي، ويتم عد المستعمرات المرئية لتقدير الحمل البكتيري لكل جرام من النسيج في المواقع المعوية والجهازية.

المصدر: فيغيروا، د. وآخرون. إنتاج وتصوير البلاستات البكتيرية والبروتوبلاستات لتوصيف مواقع الببتيدات المضادة للميكروبات. J. Vis. Exp. (2018).يوضح هذا الفيديو تحضير البلاستيدات السميكة من بكتيريا سالبة الغرام على شكل قضيب. تنمو البكتيريا بوجود مضاد حيوي لتكوين خيوط ممدودة. يتم غسل هذه القطع بمحلول مفرط التوتر ومعالجة بمحلول تحلل لإزالة الجدار الخارجي للخلية. يشكل المعالجة منخفضة التوتر الكرويات الصلبة، التي تثبت بمحلول إيزوتوتر مبرد وتخزن في ظروف باردة.

المصدر: سيغال، ن.، وآخرون. تنقية الحمض النووي الريبي من الليستيريا مونوسيتوجينات المزروعة داخل الخلايا في خلايا البلاعمية. J. Vis. Exp. (2016).يوضح هذا الفيديو عزل البكتيريا الممرضة الداخلية من البلعم المشتقة من نخاع العظم المصابة (BMDMs). يسمح للبكتيريا بالالتصاق بخلايا المضيف، وتغسل البكتيريا غير المرتبطة بعيدا. بعد الاستيعاب، يضاف مضاد حيوي للقضاء على البكتيريا غير المداخلة. يتم تحلل الخلايا المضيفة، وطرد مركزها، ويتم ترشيح المادة الفائقة لالتقاط البكتيريا على ورق المرشح، الذي يتم تجميده...

المصدر: تيمكين، إم. آي. وآخرون. اختبارات الزراعة المشتركة عالية الإنتاجية لدراسة التفاعلات الميكروبية. J. Vis. Exp. (2019)يعرض هذا الفيديو اختبارا في المختبر لدراسة التفاعلات الميكروبية بين كورينباكتيريوم بروبينكوم والمكورات العنقودية في زراعة مشتركة.

المصدر: مادنسباتشر، ج. ه. وفيسلر، م. ب. طريقة غير جراحية وغير مكثفة تقنيا لتحفيز وتصوير الالتهاب الرئوي البكتيري التجريبي في الفئران. J. Vis. Exp. (2016)يوضح هذا الفيديو عملية قياس الحمل البكتيري في طحال فأر مصاب لتقييم شدة العدوى. يتم تخفيف الطحال المتجانس بشكل متسلسل وطلائه لتحديد العبء البكتيري الكلي. توفر البيانات الناتجة رؤى حول تفاعلات المضيف والممرض داخل الأنسجة الجهازية.

خذ زراعات خلايا المثانة البولية البشرية في صفيحة متعددة الآبار.حضن الزراعة الضابطة باستخدام بكتيريا ممرضة من النوع البري Enterobacter cloacae، وهي بكتيريا ممرضة ذات هياكل شبه الشعر على سطح البكتيريا.ترتبط وحدة FimH الفرعية في البيلي بمستقبل الخلية المضيفة، مما يربط البكتيريا البرية بالخلية المضيفة.حضن الثقافة التجريبية بكلوكاي معوي متحول يفتقر إلى FimH.بدون FimH، تفشل البكتيريا المتحولة في الالتصاق بخلايا المضيف.بعد الحضانة، اغسله باستخدام حاجز لإزالة البكتيريا غير المربوطة.أضف حاجز التحلل...

تناول معلقات من سلالة مقاومة للمضادات الحيوية من بكتيريا ممرضة.عالج معلقا بمركب مضاد حيوي قصير يعطل الغشاء، والآخر بمركب قصير ومركب أطول يتفاعل مع الغشية.حضن كلا المعلقين مع التحريك. تحاكي هذه المركبات بنية الطبقة الثنائية الدهنية، مما يمكن من إدخالها تلقائيا في أغشية البكتيريا.المركب القصير يمتد فقط على جزء من سمك الغشاء، مما يخلق عدم تطابق هيكلي. هذا التفاوت يجهد الغشاء، ويخلل بسلامته، ويؤدي إلى موت الخلية.في العلاج المركب، يدمج المركب الأطول في الطبقة الثنائية ويعيد تنظيمها، مما يسهل إدخال...

المصدر: براون، أ. أو. وآخرون. تصور المكورات العقدية الرئوية داخل الآفات القلبية الدقيقة وإعادة تشكيل القلب اللاحقة. J. Vis. Exp. (2015).يوضح هذا الفيديو التصوير المجهري للآفات الدقيقة البكتيرية في أنسجة قلب الفأر. يتم جمع قلب الفأر المصاب بالمكورات الرئوية العقدية وغسله وتثبيته قبل معالجته للحصول على القطع التاجية. تصبغ هذه الأقسام بالهيماتوكسيلين والإيوزين وتفحص تحت المجهر لرؤية البكتيريا الموجودة داخل الآفات الدقيقة.

المصدر: بافا-ريبول وآخرون. اكتشاف مسببات الأمراض البكتيرية المنقولة عن طريق الغذاء من ذباب القذر الفردي. J. Vis. Exp. (2015)يوضح هذا الفيديو طريقة تعتمد على PCR تقوم بتضخيم الحمض النووي البكتيري المستهدف من عينات الذباب المخصبة باستخدام أقراص خاصة بمسببات الأمراض، مما يتيح الكشف في الوقت الحقيقي عن الفلورة وتحليل منحنى الذوبان لتأكيد وجود مسببات الأمراض المنقولة عن طريق الغذاء في الحشرات الفردية.

المصدر: كالاتايود أرويو، م.، وآخرون. تقييم جدوى اتحاد بكتيريا صناعي على واجهة المضيف والميكروب في المختبر. J. Vis. Exp. (2018).يعرض هذا الفيديو نموذجا لمضيف وميكروب في الأمعاء في المختبرات لدراسة فعالية البكتيريا. يتم حضن زراعة مشتركة لخلايا Caco-2 وHT29-MTX مع بكتيريا معالجة مسبقا في ظروف هضمية محاكاة. يتم تقييم سلامة حاجز الظهارة باستخدام مقاومة كهربائية عبر الظهارة، وتجمع كسور من الوسط، والمخاط المذاب، وتحليل الخلايا المحللة، والحطام الخلوي.

المصدر: تشين، ه. وآخرون. الكشف الدقيق والمحدد لمسبب تجريب الحمضيات Candidatus liberibacter spp. باستخدام PCR التقليدي على عينات أنسجة أوراق الحمضيات. J. Vis. Exp. (2018)يوضح هذا الفيديو استخراج الحمض النووي الجيني الكلي من نسيج أوراق الحمضيات الملوثة ببكتيريا ممرضة. يتيح البروتوكول استرجاع موثوق للحمض النووي للكشف اللاحق عن ممرض محدود اللحاء باستخدام PCR.

Source: Pett, N., et al. T4 Bacteriophage and E. coli Interaction in the Murine Intestine: A Prototypical Model for Studying Host-Bacteriophage Dynamics In Vivo. J. Vis. Exp. (2024).This video demonstrates the in vivo interaction between T4 bacteriophage and E. coli in the murine intestine, and the fecal spot plating method to quantify their coexistence by measuring bacterial colonies and phage plaques.

Source: Alshehri, M. et. al., Organotypic Tissue Model Systems for Investigating Host-Pathogen Interactions In Vitro. J. Vis. Exp. (2025)This video demonstrates a co-culture model using multi-species oral biofilms and human oral epithelium. It highlights epithelial immune activation and enables the downstream analysis of host-pathogen interaction.