细菌致病机制与宿主相互作用

来源： Jung, A. L., 等. Legionella pneumophila 外膜囊泡：分离及其对巨噬细胞促炎潜能的分析。J. Vis. Exp. (2017)本视频演示了利用连续离心、无菌过滤和超速离心从Legionella...

从含有非复制性持续存在阶段（NRP阶段）的结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）的试管开始，该阶段具有增厚的外层。向一个试管中加入玻璃珠，并振荡以机械破坏分枝杆菌的外层，增强其通透性。 接着，将珠磨处理的分枝杆菌悬液转移至新的离心管中。向未经处理和经珠击破碎的细胞悬液中加入荧光标记的利福平（一种抗结核抗生素）。振荡孵育，使荧光标记的利福平进入分枝杆菌。随着时间的推移，越来越多的利福平进入分枝杆菌。离心样品以分离细胞，并移除含有未结合利福平的上清液。 用新鲜培养基重悬分枝杆菌。使用流式细胞术分析样品。当细胞通过激光束时，会发出与细胞内荧光标记的利福平成正比的荧光信号。在不同时间点，未经处理的 NRP...

从含有禽致病性 E. coli 或 APEC 的培养基悬浮液开始。APEC...

来源： Spiesz, E. M., 等，利用自制生物打印机对工程化生物膜进行三维图案化。J. Vis. Exp. (2019)本视频展示了一种用于比较含有对照菌株或基因工程菌株的3D打印海藻酸盐图案的方法。实验菌株在诱导后可产生卷曲纤维（curli...

来源：Tay, S. B., et al. 利用工程化群体感应淬灭乳糖酶实现对致病性生物膜的抗毒力破坏。J. Vis. Exp.

来源：Schlafer, S, 和 Frost Kristensen, M. 利用共聚焦显微镜监测跨界生物膜中的细胞外 pH 值。J. Vis. Exp. (2020)本视频展示了在模拟口腔环境条件下，对Streptococcus mutans和Candida...

来源：Kurz, D. L., 等。用于研究多孔介质中生物堵塞的微流控平台。J. Vis. Exp.

来源： Perinbam, K., 和 Siryaporn, A. 利用阿米巴进行快速基于图像的细菌毒力检测。 J. Vis. Exp.

来源：Bucher, T., 等. 以B. subtilis生物膜为模型研究小分子生物膜抑制剂的方法学。J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了一种利用枯草芽孢杆菌（Bacillus...

来源： Bucher, T., 等．用于研究枯草芽孢杆菌生物膜以表征小分子生物膜抑制剂的方法学．J. Vis. Exp.

来源：Beaudoin, T., et al. 利用带腔载玻片模型可视化痰液对生物膜发育的影响. J. Vis. Exp.

从营养培养基中的细菌悬液开始。将悬液加入多孔板中并孵育。培养基中的营养物质促进细菌的生长和附着。黏附的细菌会分泌由多糖、蛋白质和DNA组成的胞外聚合物，形成一层生物膜。用缓冲液多次洗涤以去除未结合的细菌。倒置培养板，以确保去除孔中残留的液体，并使生物膜干燥。使用固定剂处理，以保存生物膜的细胞组分。加入一种阳离子染料，该染料可结合生物膜中带负电荷的胞外聚合成分。用缓冲液冲洗并重复数次，以去除未结合的染料。加入溶剂以释放生物膜结合的染料。使用酶标仪测量释放染料的颜色强度，以此作为细菌生物膜形成的读数。...

来源：Hu, Y., et al。利用体外批次发酵系统分析内源性物质与人体肠道微生物群之间的相互作用。J. Vis. Exp.

来源： Schumacher, D.，和 Sogaard-Andersen, L. 缓慢生长的社会性细菌完整营养细胞周期的荧光活细胞成像 黏球菌属黄单胞菌。J. Vis. Exp.

来源：Tokunou, Y. et. al., 电化学检测重氢动力学同位素效应对Shewanella oneidensis MR-1胞外电子传递的影响。J. Vis. Exp.

来源： Naji, A., 等研究由Mitis群引起的氧化应激 链球菌 在 秀丽隐杆线虫. 视频实验杂志 (2019)本视频展示了利用表达绿色荧光蛋白标记的SKN-1的秀丽隐杆线虫（C. elegans），通过检测绿色荧光来监测氧化应激水平。将线虫暴露于 S. gordonii 显示强烈的核荧光，证实病原体诱导的应激反应，而饲喂的 E. coli...

来源：Nielsen, T. B., et al., 呼吸机相关性和医院获得性细菌性肺炎的小鼠口咽部吸入模型。J. Vis. Exp.

来源： Zhao, K., et al. 一种体外模型用于研究5-氨基乙酰丙酸介导的光动力疗法对Staphylococcus aureus生物膜的影响。J. Vis. Exp.

来源：Escudero, J. A., 等. 多拷贝质粒在抗生素耐药性进化中的作用检测。J. Vis. Exp. (2018)本视频展示了通过逐步增加头孢唑林暴露浓度，比较三种含有不同拷贝数氨苄青霉素抗性基因的大肠杆菌（E.

来源：Saragliadis, A., 等．利用可切除抗生素抗性盒通过P1转导在Escherichia coli中构建基因缺失．J. Vis. Exp. （2018）本视频展示了通过噬菌体介导的方式，将携带可切除抗生素抗性盒的供体DNA转入大肠杆菌（Escherichia...

来源：Claes, J., 等，流动条件下研究细菌黏附血管壁的体外与体内模型。J. Vis. Exp.

来源： Holt-Torres, P. S. 等 纳米颗粒与纳米结构表面抗菌活性的评估 体外. 视频实验杂志...

来源：Dubois, V., et al。用于吞噬细胞内复制的Mycobacterium abscessus毒力标志物的鉴定。J. Vis. Exp.

来源：Nagre, N., 等．小鼠肺泡巨噬细胞吞噬作用与细菌清除实验．J. Vis. Exp.

来源： 张，S. 等颅内蛛网膜下腔感染途径用于研究作用 猪链球菌 小鼠感染模型中脑膜炎的生物膜研究 视频实验杂志...

来源：Radulovic, K., et al. 向小鼠注射脂多糖以模拟肠道屏障受损后微生物来源产物的进入。 J. Vis. Exp.

取猪肾细胞培养物，其中一组培养物预先用提高溶酶体pH值的抑制剂处理，以损害自噬-溶酶体降解功能。加入病原菌并离心，以增强宿主与病原菌的接触。孵育以促进细菌侵入并内化至内吞囊泡中。内化的细菌消耗宿主营养物质进行复制，从而引发代谢应激。这种应激会激活自噬，其中自噬膜在囊泡周围扩展，形成自噬体。在未经处理的细胞中，自噬体靶向细菌并将其运送至溶酶体进行降解。在抑制剂处理的细胞中，自噬清除功能受损，导致细菌载量升高。感染后，洗涤细胞并加入抗生素以清除细胞外细菌。加入一种酶以消化细胞外基质并使细胞脱落。通过机械裂解细胞以释放胞内细菌。接种裂解液以促进细菌生长。未处理细胞中菌落数量减少，证实了自噬-溶酶体降解途径在清除胞内细菌中的作用。...

取一培养皿贴壁生长的小鼠巨噬细胞。用含有信号分子Wnt5A的缓冲液处理测试孔，对照孔仅使用缓冲液处理。接种细菌病原体并进行培养。在实验细胞中，Wnt5A 激活一条信号级联通路，促进细胞骨架重排，从而增强细菌向吞噬体的摄取；而缺乏该信号通路的对照细胞则内化较少的细菌。洗涤以去除未被内化的细菌，然后在含有抗生素的培养基中孵育，以清除残留的胞外细菌。Wnt5A...

来源：In, J. G.,等. 利用人类结肠类器官单层培养研究病原体、共生菌与宿主肠上皮之间的相互作用. J. Vis. Exp.

来源： 卢克宁，H. 等 建立结核病模型 Mycobacterium marinum 感染的成年斑马鱼。 视频实验杂志 (2018).

来源： Sigal, N., 等细胞内生长细菌的RNA纯化 单核细胞增生李斯特菌 在巨噬细胞中。 视觉实验杂志. (2016)本视频演示了从感染的小鼠巨噬细胞中分离的单核细胞增生性李斯特菌（Listeria...

来源：Vonaesch, P. et. al., 哺乳动物细胞经细菌攻击后应激颗粒形成的免疫荧光分析。J. Vis. Exp. (2017)本视频展示了上皮细胞感染致病菌 Shigella flexneri...

从感染了可形成胞内包涵体的病原菌的免疫细胞培养物开始。细菌感染会损害免疫细胞中的抗原呈递通路。以未感染的培养物作为对照。接下来，加入模式蛋白抗原并孵育。免疫细胞摄取、加工并将模型抗原衍生的多肽呈递在MHC-I分子上。孵育后，洗涤细胞以去除任何未处理的抗原。固定细胞，然后加入淬灭剂以中和固定剂。加入经基因改造的CD8+...

来源： Chetrit, D., 等结合活细胞成像与冷冻电子断层扫描技术解析时空动态特征 嗜肺军团菌 Dot/Icm 分泌系统 视频实验杂志.

来源：Winston, J. A., et al. 利用头孢哌酮处理的小鼠模型研究临床相关性 Clostridium difficile 菌株 R20291。J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了用抗生素预处理小鼠后接种Clostridium...

来源：Winston, J. A. 等. 经头孢哌酮处理的小鼠模型感染临床相关性Clostridium difficile 菌株 R20291。J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了利用选择性培养技术对感染小鼠模型粪便样本中的Clostridium...

来源： Berens, C. 等 应用可诱导表达系统研究细菌毒力因子对细胞内信号通路的干扰 视频实验杂志 (2015)本视频展示了利用免疫印迹技术检测细菌效应蛋白 CaeB...

来源：Yuan, Z., et al. 脂多糖诱导的脓毒症肺损伤中的支气管肺泡灌洗外泌体。 J. Vis. Exp.

来源：Li, T., et al. 研究香烟烟雾对肺上皮细胞中 Pseudomonas 感染的影响。 J. Vis. Exp.

来源：Ahn, J. J., 等 ，利用Listeria monocytogenes实验性感染作为研究宿主干扰素-γ应答的模型。J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了从感染单核细胞增生李斯特菌（Listeria...

来源： Barbero, A. M., 等荧光检测法在研究中的应用 结核分枝杆菌 与免疫受体SLAMF1的相互作用。 J. Vis. Exp.

来源： Zhang, C. 等 细胞内感染模型的建立与评估 金黄色葡萄球菌. J. Vis. Exp.

来源：Gutiérrez, S., et al., 从巨噬细胞中分离含有Salmonella typhimurium的吞噬体。J. Vis. Exp.

来源：Mills, B., 等，利用共聚焦激光内窥显微镜对新型细菌特异性探针在离体人肺组织上的光学筛选。J. Vis. Exp. (2017)本视频展示了利用光纤共聚焦荧光显微镜对悬浮液及肺组织中的荧光标记金黄色葡萄球菌（Staphylococcus...

来源： Ng, K. M., Tropini, C. 通过荧光成像可视化肠道微生物群-宿主相互作用 原位 杂交、凝集素染色与成像 视频实验杂志...

来源：Siva-Jothy, J. A., 等，口腔细菌感染与黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）的细菌排出。J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了监测细菌排出的实验步骤 黑腹果蝇...

来源：de Vries, C. R., et al., 一种迟发接种的慢性Pseudomonas aeruginosa伤口感染模型。J. Vis. Exp. (2020)。本视频展示了一种生物发光成像技术，用于监测活体小鼠模型中细菌感染的进展。携带 luxABCDE...

来源：Shi, J., et al. 从植物病原菌分泌效应子中筛选和鉴定RNA沉默抑制因子. J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了一种共渗透测定法，用于鉴定在Nicotiana benthamiana...

来源：Niu, L., et al. 通过活体显微镜观察结核分枝杆菌感染期间斑马鱼胚胎中巨噬细胞的溶细胞性死亡。 J. Vis. Exp. (2019)本视频展示了利用活体共聚焦显微镜观察斑马鱼胚胎中巨噬细胞裂解性细胞死亡的过程 Mycobacterium marinum...

来源：Seman, B. G., 等. 革兰氏阴性菌败血症的新生儿成像模型. J. Vis. Exp.

来源：Choi, Y. S., 等。利用地高辛标记的靶向16S rRNA的DNA探针在石蜡包埋组织中进行细菌原位检测。J. Vis. Exp.

来源： Valentine, M. E. 等人，框内基因缺失突变体的构建 铜绿假单胞菌 并在简单的感染小鼠模型中检测毒力减弱情况。 J. Vis. Exp.

来源：Luyts, N., et al. 利用生物发光成像对小鼠尿路感染及其治疗进行纵向随访。J. Vis. Exp. (2021)。本视频展示了利用生物发光的E.

来源：O'Brien, V. P., 等，小鼠膀胱暴露于Gardnerella vaginalis诱发反复性大肠杆菌尿路感染。J. Vis. Exp.

来源：Bernut, A., 等，利用斑马鱼胚胎解析和成像Mycobacterium abscessus的致病机制与菌索形成。 J. Vis. Exp. (2015)。本视频演示了一种从感染的斑马鱼胚胎中分离和定量脓肿分枝杆菌（Mycobacterium...

来源： 贝尔努特，A. 等解析与成像病原性及索状结构 脓肿分枝杆菌 在斑马鱼胚胎中。 视频实验杂志 (2015)本视频展示了一种利用表达荧光巨噬细胞并感染了荧光标记病原体的转基因斑马鱼胚胎的实验方案 脓肿分枝杆菌...

从可能含有粪大肠菌群（包括大肠杆菌 E. coli）的污染水样开始。在蒸馏水中进行连续稀释，以降低浊度和微生物负荷。将所需稀释的样品与营养培养基混合，并加载到微流控芯片中。使用真空过滤将细菌捕获在芯片蛇形通道内的膜上。向培养池上层加入营养培养基，并进行孵育以提高细菌回收率。用含有携带荧光素酶基因的大肠杆菌（E. coli）特异性噬菌体的溶液替换培养基。孵育以允许噬菌体感染，期间噬菌体DNA进行复制，降解宿主DNA，并形成新的噬菌体，同时产生荧光素酶。随后，感染的细胞裂解释放荧光素酶。采用真空过滤将荧光素酶转移至捕获膜上。加入一种能与荧光素酶反应产生发光信号的底物。使用光电倍增管测量发光强度，该发光强度与水样中存活的 E. coli...

来源：Makowski, Ł., et al．利用延时荧光显微镜对细菌捕食者Bdellovibrio bacteriovorus生命周期进行活细胞成像．J. Vis. Exp. (2020)本视频展示了在琼脂糖垫下对固定化的E. coli被Bdellovibrio...

来源：Tay, S. B., et.al. 利用工程化群体感应淬灭乳糖酶实现对致病性生物膜的抗毒力破坏。 J. Vis. Exp.

来源： Collins, A. J., et al., 从口腔中建立共生性 Saccharibacteria 的稳定二元培养物。J. Vis. Exp.

来源：Matthysse, A. G. 实验室条件下测定细菌对植物表面的黏附能力。J. Vis. Exp.

来源： Matthysse, A. G. 实验室条件下测定细菌对植物表面的黏附性。J. Vis.

来源：Brown, A. O., 和 Orihuela, C. J. 肺炎链球菌在心脏微小病变中的可视化及其后续心脏重塑。J. Vis. Exp.

来源：Specker, J. T., et al．利用成像质谱技术分析琼脂上及感染过程中组织内细菌菌落以研究微生物协作．J. Vis. Exp. (2022)本视频展示了基质辅助激光解吸/电离（MALDI）质谱技术在可视化感染小鼠肠道组织中氨基酸分布的应用 艰难梭菌，单独使用或联合使用 粪肠球菌该过程包括组织制备、基质涂布、激光电离以及氨基酸离子的检测，以生成空间离子图像。结果揭示了微生物间的协同作用， E. faecalis 通过释放鸟氨酸和消耗精氨酸，改变肠道环境，从而增强 C. difficile...

来源：Bucher, T., et. al., 利用枯草芽孢杆菌生物膜模型研究小分子生物膜抑制剂的方法学。J. Vis.

来源：Beaudoin, T., et al. 利用带腔载玻片模型可视化痰液对生物膜形成的影响。 J. Vis. Exp. (2016)本视频演示了一种 体外...

取含有纳米复合材料的培养管，该材料由过渡金属与碳组合而成。将耐药的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性病原菌分别接种至不同的试管中作为测试样本。以未经处理的细菌作为阴性对照，以抗生素处理的细菌作为阳性对照。将样品置于振荡条件下孵育。在革兰氏阴性细菌中，多孔的外膜和较薄的肽聚糖层有利于纳米颗粒进入，导致膜结构破坏。随后，这些纳米颗粒会触发活性氧物种的生成，从而损伤DNA、蛋白质和膜结构，导致细菌死亡率升高。在革兰氏阳性菌中，富含磷壁酸的厚肽聚糖层限制了纳米颗粒的渗透，导致细菌死亡率较低。接下来，使用培养基对细菌悬液进行连续稀释。将稀释液接种至琼脂平板，培养以使菌落形成，并计数菌落。与两个对照组相比，测试样品中菌落数量较少，证实了纳米颗粒的抗菌作用。然而，该作用在革兰氏阴性菌中比在革兰氏阳性菌中更强。...

来源：Bratton, B. P., et al., 用于精确细胞表征与精准蛋白质定位的细菌细胞三维成像。J. Vis. Exp.

来源： Le, T. A. N., 等测量细菌和化学物质对肠道通透性的影响 秀丽隐杆线虫. 视频实验杂志 (2019)本视频展示了一种基于荧光的检测方法，用于定量暴露于铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）的秀丽隐杆线虫（C. elegans）肠道通透性。与喂食大肠杆菌（Escherichia...

来源：O'Brien, V.P. 等 复发性 大肠杆菌 由尿路感染引发的 Gardnerella vaginalis 小鼠膀胱暴露术 J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了制备一种 Gardnerella vaginalis...

来源： Lenhard, A. 等 一种小鼠模型用于研究转变过程 肺炎链球菌 从定植者到病原体：病毒共感染重现年龄加剧的疾病进程 视频实验杂志 (2022)本视频展示了一种小鼠共感染模型，其中流感病毒引发向 肺炎链球菌...

来源： Lenhard, A., 等 一种小鼠模型用于研究转变过程 肺炎链球菌 从定植者到病原体：病毒共感染重现年龄加剧的疾病进程 视频实验杂志...

来源：Cross, T., 等，一种从土壤样品分离物中分离节杆菌噬菌体物种的优化富集技术。J. Vis.

来源：Conover, M. S. et. al., 建立并表征小鼠模型中的尿路感染与导管相关性尿路感染。J. Vis. Exp. (2015)本视频展示了在感染了表达β-半乳糖苷酶的Escherichia...

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来源：Wang, Y., 等. 利用生物发光成像技术对耐多药Acinetobacter baumannii烧伤感染进行蓝光抗菌治疗的体内研究。J. Vis. Exp. (2017)本视频展示了对感染携带生物发光操纵子的Acinetobacter...

来源： Barbero, A. M., 等。 用于研究的荧光检测方法 结核分枝杆菌 与免疫受体SLAMF1的相互作用。 J. Vis. Exp. ( (2025)本视频展示了一种基于荧光的检测方法，用于研究巨噬细胞受体与结核分枝杆菌（Mycobacterium...

来源： Li, J., 等 建立幼年斑马鱼感染模型 艰难梭菌（Clostridioides difficile） 视频实验杂志...

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来源： 卡萨诺瓦，A. 等基于显微镜的高通量筛选参与宿主因素的检测方法 布鲁氏菌 Hela细胞感染 视频实验杂志 (2016)本视频展示了利用siRNA介导的STING基因敲低技术，对上皮细胞中布鲁氏菌（Brucella...

来源：Miquel Guennoc, C., 等。利用共聚焦显微镜和电子显微镜对丝状真菌菌落上的细菌生物膜进行定性多尺度分析的新方法。J. Vis. Exp.

来源： Harris, S. L., 等监测细菌定植与维持 拟南芥 漂浮式水培系统中的根系 J. Vis. Exp. (2019)本视频演示了一种用于监测在无土系统中生长的拟南芥（Arabidopsis...

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来源：Hunt, A. M. A., 等. 走向光明的一侧：在糖尿病无毛小鼠模型中对慢性伤口内 Pseudomonas aeruginosa 生物膜感染进行活体监测。J. Vis.

来源： 刘，X. 等细菌叶片浸润法用于精细表征植物防御反应 拟南芥-丁香假单胞菌 病理系统 视觉实验杂志. (2015).本视频演示了一种评估感染了Pseudomonas syringae的拟南芥（Arabidopsis...

来源：Ahn, J. J., et al．利用单核细胞增生李斯特菌感染作为研究宿主干扰素-γ应答的模型．J. Vis. Exp.

来源：Siva-Jothy, J. A., 等．黑腹果蝇的口腔细菌感染与排菌．J. Vis. Exp. (2018)该视频展示了利用致病菌对黑腹果蝇（Drosophila...

来源：Mueller, A., 等．一种研究结核病与疟疾共感染的实验模型：基于Mycobacterium tuberculosis和Plasmodium berghei自然传播条件下的研究．J. Vis. Exp. （2014）本视频展示了使用基于雾化器的暴露舱系统将结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis...

来源： de Vries, C. R., 等一种慢性延迟接种模型 铜绿假单胞菌 伤口感染 视频实验杂志 (2020)本视频展示了将发光的Pseudomonas...

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来源：Seman, B. G., et al. 一种革兰氏阴性菌败血症的新生儿成像模型。J. Vis. Exp.

来源：Shi, J., et al., 从植物病原菌分泌效应子中筛选和鉴定RNA沉默抑制因子。J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了通过乙酰丁香酮诱导根癌农杆菌（Agrobacterium...

来源：Behera, R.K. et. al., 一种基于荧光的细菌基因调控研究方法在感染组织中的应用。 J. Vis. Exp. (2019)本视频演示了制备溶血性Staphylococcus...

来源：Shi, J., et al., 从植物病原菌分泌效应子中筛选与鉴定RNA沉默抑制因子。J. Vis. Exp. (2020)本视频演示了通过乙酰丁香酮诱导根癌农杆菌（Agrobacterium...

来源： Chen, Y., 等评估毒力与致病机制 气单胞菌属 感染在A中 秀丽隐杆线虫 模型。 视频实验杂志 (2018)本视频展示了一种利用秀丽隐杆线虫（C.

从携带源自人结直肠癌细胞的皮下异种移植瘤的免疫缺陷小鼠开始。将经改造后可分泌抗癌蛋白、且可安全食用的乳酸菌 Pediococcus pentosaceus...

从大腿皮下植入实体瘤的小鼠开始实验。通过尾静脉向小鼠注射一种非致病性的、经基因工程改造的Salmonella typhimurium菌株。细菌在血液中循环，并选择性地在缺氧且免疫抑制的肿瘤微环境中富集。它们携带一种编码治疗性融合肽的质粒，该融合肽由细胞穿透肽和促凋亡蛋白的线粒体靶向结构域组成，同时携带噬菌体来源的裂解蛋白。这些基因由L-阿拉伯糖诱导型启动子调控。通过腹腔注射 L-阿拉伯糖以诱导细菌基因表达和蛋白质生成。裂解蛋白可触发细菌破裂，从而将融合肽释放到肿瘤微环境中。CPP 能穿透肿瘤细胞膜，使 MTD 进入细胞。进入细胞后，MTD...

来源：Chen, Y., et al. 利用秀丽隐杆线虫模型评估气单胞菌感染的毒力与致病机制。J. Vis. Exp. (2018)。本视频演示了利用嗜水气单胞菌（Aeromonas）对秀丽隐杆线虫（C. elegans）进行的液体毒性测定实验，该方法通过测量线虫在营养受限的液体环境中的存活情况来评估细菌的毒力。该实验可根据毒素对C.

来源：Nag, D., 等 利用成年斑马鱼模型定量分析霍乱弧菌定植与腹泻。J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了一种定量成年斑马鱼肠道细菌载量的实验方案，这些斑马鱼感染了耐抗生素的霍乱弧菌（Vibrio...

来源： Nag, D., 等。 量化 霍乱弧菌 成年斑马鱼模型中的定植与腹泻研究 J. Vis. Exp. (2018)本视频演示了将致病性霍乱弧菌（Vibrio...

来源： 帕特拉斯，K. A.，多兰，K. S. 一种B族链球菌感染的小鼠模型 链球菌 阴道定植 视频实验杂志 (2016)本视频展示了经激素处理的雌性小鼠的准备及其阴道接种B族链球菌的过程 链球菌...

来源： Patras, K. A. & 多兰，K. S. 一种B族链球菌感染的小鼠模型 链球菌 阴道定植 视频实验杂志 (2016)本视频展示了阴道B族链球菌的定量方法 链球菌...

来源：Conover, M. S., et al., J. 建立并表征小鼠模型中的尿路感染与导管相关性尿路感染。J. Vis. Exp.

来源：Flores, E., et al．利用原生动物尾草履虫作为食物传播感染斑马鱼幼虫的载体．J. Vis. Exp. （2019）．本视频演示了通过喂食感染了荧光标记大肠杆菌（E.

来源：Wang, Y., et al. 利用生物发光成像技术对耐多药Acinetobacter baumannii烧伤感染进行抗菌蓝光治疗的体内研究。J. Vis. Exp.

来源：Ditkowski, B.，等。一种用于研究细菌对移植物组织黏附的体外平行板灌注系统模型。J. Vis. Exp.

来源：Beernink, B. M. et al. 利用重组狗尾草花叶病毒和甘蔗花叶病毒侵染性克隆注射法直接进行玉米幼苗农杆菌接种。J. Vis. Exp. (2021)本视频演示了 农杆菌介导的重组病毒克隆递送至玉米幼苗以实现基因沉默。该方法概述了以下流程： 农杆菌...

来源：Gupta, K., 等. 肾盂肾炎大鼠模型中大肠杆菌的肾内注射. J. Vis. Exp. (2017).本视频演示了将E.

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来源：Brzozowski, R. S. et al. 利用活细胞荧光显微镜研究细菌中亚细胞蛋白定位及细胞形态变化。J. Vis. Exp.

来源： McMullen, P. D., Freitag, N. E. 利用培养的心脏细胞评估细菌侵袭及感染小鼠心脏定植 单核细胞增生李斯特菌. 视频实验杂志 (2015)本视频演示了将单核细胞增生李斯特菌（Listeria...

来源： 詹，Y. 等光漂白可实现对FtsZ环的超分辨率成像 原绿球藻（Prochlorococcus） 视频实验杂志...

来源：Zhang, M. 等，通过受激拉曼散射成像检测单个细菌中氘掺入实现快速抗菌药物敏感性测试。J. Vis. Exp.

来源： Hiroyasu, A., D 等。 从血细胞中提取 黑腹果蝇 用于微生物感染与分析的幼虫 视频实验杂志...

来源： Hiroyasu, A., 等. 血细胞的提取方法 黑腹果蝇 用于微生物感染与分析的幼虫 视频实验杂志 (2018)本视频展示了利用高分辨率共聚焦成像技术对感染了贝氏柯克斯体（Coxiella burnetii）的黑腹果蝇（Drosophila...

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来源：Montefusco-Pereira, C. V. 等. 铜绿假单胞菌...

来源：Nguyen, J. Q., et. al. 使用土拉弗朗西斯菌对Fischer 344大鼠进行气管内接种。J. Vis. Exp.

来源：Claes, J., et al，在流动条件下研究细菌对血管壁黏附的体外与体内模型。J. Vis. Exp.

来源：Poore, K., 等. 利用志贺氏菌进行上皮细胞感染分析。视频实验杂志（2024）本视频展示了一种用于评估的体外实验方法 志贺氏菌...

来源： Zhang, C., 等，细胞内感染模型的建立与评估 Staphylococcus aureus. J. Vis. Exp. (2025)该视频展示了分离含有金黄色葡萄球菌（Staphylococcus...

来源： Berthold, A., et al. 疏螺旋体属博氏疏螺旋体复合体及回归热疏螺旋体的培养方法。 J. Vis.

来源：Morgan, E., 等. 野生Caenorhabditis线虫的选择性清洗以富集肠道微生物组细菌。J. Vis. Exp.

来源：Petersen, C. et. al., 模式线虫Caenorhabditis elegans天然微生物群的分离与表征。J. Vis. Exp. (2022)本视频展示了与秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）相关的细菌物种的分离与培养方法。通过基于微珠的秀丽隐杆线虫（C.

来源：Liu, X., et al. 使用抗生素处理蚊子的细菌口服饲喂实验。 J. Vis. Exp.

取一只具有正常肠道菌群的对照小鼠和一只肠道菌群耗竭的实验小鼠。菌群耗竭会破坏肠道屏障的完整性。这使得细菌能够穿过血管进入肝组织。向两只小鼠注射乙型肝炎病毒（HBV）质粒，以诱导肝脏组织中的HBV感染。在对照小鼠中，T细胞通过其受体与病毒抗原的相互作用识别被感染的肝细胞，并产生细胞毒素以诱导细胞死亡。在实验小鼠中，从肠道移位的细菌释放出与T细胞相互作用的代谢物。这种相互作用会抑制T细胞的活化，从而阻止它们清除被感染的肝细胞。定量检测多种乙型肝炎病毒标志物，以确认肠道微生物群耗竭小鼠中病毒的长期感染。...

从悬浮于培养基中的细菌生物传感器培养物开始。这些经过基因改造的细菌可产生一种转录因子，当其与特定的粪便代谢物结合后，会激活与荧光报告基因相关的启动子。向该培养物中加入含有参与宿主-微生物组相互作用的代谢物（如乳酸）的过滤后人粪便样本。用新鲜培养基稀释该混合物，以维持最佳反应体积。在无振荡条件下孵育，以模拟人体肠道环境。粪便代谢物扩散进入细菌细胞，并与转录因子结合。该复合物结合至启动子，从而导致报告基因的表达和蛋白质的产生。混合溶液以确保均匀分布，用缓冲液稀释后，采用流式细胞术进行分析。当细菌细胞通过激光时，报告蛋白发出的荧光可证实特定粪便代谢物的存在。...

从一只上颌磨牙周围绑有缝线的大鼠模型开始，以支持细菌定植。使用凝胶状溶液，反复涂抹可引起牙龈疾病的口腔致病菌于缝线上。细菌在缝线周围的牙龈中定植。定植会引发炎症并造成组织损伤。细菌释放的毒素会扩散到受损组织中，并进入血液。这些循环毒素到达肠道后，可引发炎症，破坏上皮屏障，并增加其通透性。毒素进入肠道环境并杀死有益细菌。这有利于致病菌的生长，从而改变肠道微生物群的平衡。采集大鼠粪便样本，并加入提取试剂以获取细菌...

来源：Yang, E., et al．从尿路感染小鼠模型中分离用于下游单细胞分析的单个胞内细菌群落．J. Vis. Exp. （2019）本视频展示了利用口控微量移液技术，从受感染小鼠膀胱中手动分离含有胞内细菌群落的单个上皮细胞的方法，从而实现对尿路感染模型中与宿主相关的可存活 E. coli...

来源： Chen, Y. 等。 评估气单胞菌感染在一种动物模型中的毒力与致病机制 秀丽隐杆线虫 模型。 视频实验杂志 (2018)本视频展示了利用致病性气单胞菌（Aeromonas）菌株在秀丽隐杆线虫（C. elegans，Caenorhabditis...

来源：Hu, Y. et.al., 利用体外批次发酵系统分析内源性物质与人体肠道微生物群之间的相互作用。J. Vis. Exp.

来源：Lo, B. C., 等。慢性沙门氏菌感染诱导的肠道纤维化。J. Vis. Exp. (2019)该视频展示了在链霉素耐药细菌慢性感染的小鼠模型中，细菌载量的定量方法 沙门氏菌 typhimurium...

来源：Figueroa, D. et. al. 细菌球状体与原生质体的制备及可视化以表征抗菌肽的定位。 J. Vis. Exp.

来源：Sigal, N., 等. 从巨噬细胞内增殖的单核细胞增生李斯特菌中提取RNA。 J. Vis. Exp.

来源：Temkin, M. I. 等．用于研究微生物相互作用的高通量共培养实验．J. Vis. Exp. (2019)本视频演示了一种 体外 研究微生物间相互作用的检测方法 Corynebacterium propinquum 和 金黄色葡萄球菌...

来源：Madenspacher, J. H. 和 Fessler, M. B. 小鼠实验性细菌性肺炎诱导与表型分析的一种非侵入性且技术要求低的方法。J. Vis. Exp.

在多孔板中培养人尿路上皮细胞。将对照培养物与野生型 Enterobacter cloacae 共同孵育，该细菌为一种具有菌毛（细菌表面的毛发状结构）的致病菌。菌毛的 FimH 亚基与宿主细胞受体结合，将野生型细菌锚定在宿主细胞上。将实验培养物与缺乏 FimH 的突变型 Enterobacter cloacae 共同孵育。没有...

取耐药性致病菌株的悬液。用一种短效的膜破坏性抗生素化合物处理一份悬液，另一份悬液则同时使用该短效化合物和一种长效的膜嵌入性化合物进行处理。将两种悬液同时振荡孵育。这些化合物可模拟脂质双层结构，从而能够自发插入细菌膜中。这种短的化合物仅跨越膜厚度的一部分，导致结构不匹配。这种不匹配会牵拉膜结构，破坏其完整性，并引发细胞死亡。在联合治疗中，较长的化合物嵌入双分子层并使其重新排列，促进较短化合物的更深插入，从而增强对膜的破坏作用。对悬液进行连续稀释，并接种至琼脂平板上。孵育以使存活的细胞形成集落。计数菌落以确定活细胞数量，并观察联合治疗的增强抗菌效果。...

来源： 布朗，A. O. 等 可视化 肺炎链球菌 心脏微损伤内的变化及随后的心脏重构。 视觉实验杂志. (2015).本视频展示了小鼠心脏组织中细菌微小病灶的显微观察。取感染肺炎链球菌（Streptococcus...

来源：Pava-Ripoll，等．从单只污秽蝇类中检测食源性细菌病原体．J. Vis. Exp. （2015）本视频展示了一种基于 PCR 的方法，该方法利用病原体特异性试剂片从富集的果蝇样本中扩增目标细菌...

来源：Calatayud Arroyo, M., et al. 在体外肠道宿主-微生物界面评估合成细菌群落的存活能力。J. Vis. Exp.

来源：Chen, H., 等．利用常规PCR对柑橘叶片组织样本中柑橘黄龙病病原菌Candidatus liberibacter spp.进行特异且准确的检测．J. Vis. Exp.

来源：Pett, N., et al. 小鼠肠道中T4噬菌体与E. coli的相互作用：体内研究宿主-噬菌体动态关系的典型模型。J. Vis. Exp. (2024)。本视频展示了T4噬菌体与小鼠肠道内E.

来源：Alshehri, M. et. al., 用于体外研究宿主-病原体相互作用的类器官组织模型系统 In Vitro。J. Vis. Exp.